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ctbctbctb新蟲(chóng) (初入文壇)
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[求助]
關(guān)于在http://eztaxon-e.ezbiocloud.net/中通過(guò)比對(duì)獲得16S rDNA同源序列問(wèn)題 已有2人參與
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請(qǐng)韓國(guó)人的網(wǎng)站http://eztaxon-e.ezbiocloud.net中,怎樣比對(duì)獲得16S rDNA同源序列。本人正在做發(fā)育樹(shù)，但不知道怎么去那個(gè)網(wǎng)站比對(duì)。我的16S rDNA序列是：CCCTGTCACTTAGGCGGCTGGCTCCAAAAGGTTACCCCACCGACTTCGGGTGTTACAAACTCTCGTGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCGGGAACGTATTCACCGCGGCATGCTGATCCGCGATTACTAGCGATTCCAGCTTCATGTAGGCGAGTTGCAGCCTACAATCCGAACTGAGAACGGTTTTATGAGATTAGCTCCACCTCGCGGTCTTGCAGCTCTTTGTACCGTCCATTGTAGCACGTGTGTAGCCCAGGTCATAAGGGGCATGATGATTTGACGTCATCCCCACCTTCCTCCGGTTTGTCACCGGCAGTCACCTTAGAGTGCCCAACTTAATGATGGCAACTAAGATCAAGGGTTGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACATCTCACGACACGAGCTGACGACAACCATGCACCACCTGTCACTCTGCTCCCGAAGGAGAAGCCCTATCTCTAGGGTTGTCAGAGGATGTCAAGACCTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAGCCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGAGTGCTTAATGCGTTAACTTCAGCACTAAAGGGCGGAAACCCTCTAACACTTAGCACTCATCGTTTACGGCGTGGACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCAGTGTCAGTTACAGACCAGAAAGTCGCCTTCGCCACTGGTGTTCCTCCATATCTCTACGCATTTCACCGCTACACATGGAATTCCACTTTCCTCTTCTGCACTCAAGTCTCCCAGTTTCCAATGACCCTCCACGGTTGAGCCGTGGGCTTTCACATCAGACTTAAGAAACCACCTGCGCGCGCTTTACGCCCAATAATTCCGGATAACGCTTGCCACCTACGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGTAGTTAGCCGTGGCTTTCTGGTTAGGTACCGTCAAGGTGCCAGCTTATTCAACTAGCACTTGTTCTTCCCTAACAACAGAGTTTTACGACCCGAAAGCCTTCATCACTCACGCGGCGTTGCTCCGTCAGACTTTCGTCCATTGCGGAAGATTCCCTACTGCTGCCTCCCGTAGGAGTCTGGGCCGTGTCTCAGTCCCAGTGTGGCCGATCACCCTCTCAGGTCGGCTACGCATCGTTGCCTTGGTGAGCCGTTACCTCACCAACTAGCTAATGCGACGCGGGTCCATCCATAAGTGACAGCCGAAGCCGCCTTTCAATTTCGAACCATGCGGTTCAAAATGTTATCCGGTATTAGCCCCGGTTTCCCGGAGTTATCCCAGTCTTATGGGCAGGTTACCCACGTGTTACTCACCCGTCCGCCGCTAACTTCATAAGAGCAAGCTCTTAATCCATTCGCTCGACTGCATGTATAGCACGCCGCAACGCCC 麻煩好心的朋友給予解答，或者幫我在http://eztaxon-e.ezbiocloud.net比對(duì)一下。多謝��！ |
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zjh20093489
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7樓2015-12-22 13:59:21
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2樓2012-04-14 22:34:13
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【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
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這是EzTaxon server 2.1的比對(duì)結(jié)果，與Bacillus anthracis ATCC 14578(T)的相似性為100%，也可能是Bacillus acidiceler CBD 119(T)的一個(gè)互補(bǔ)序列 Time (y-m-d h:m) Tasks Job Type Query Hit Accession Similarity 2012-4-15 0:55 Identify UserSeq Bacillus anthracis ATCC 14578(T) AB190217 100.000 2011-12-14 16:24 Identify UserSeq Marinobacter algicola DG893(T) ABCP01000031 99.533 2011-12-14 14:20 Identify UserSeq Bacillus nanhaiensis JSM 082006(T) GU477780 99.790 2011-12-14 14:5 Identify UserSeq Bacillus nanhaiensis JSM 082006(T) GU477780 99.790 2011-12-14 11:33 Identify UserSeq Idiomarina zobellii KMM 231(T) AF052741 98.974 2011-12-14 10:13 Identify UserSeq Sulfitobacter pontiacus DSM 10014(T) Y13155 99.785 2011-12-14 10:10 Identify UserSeq Phaeobacter caeruleus CCUG 55859(T) AM943630 99.857 2011-12-13 20:57 Identify UserSeq Halomonas shengliensis SL014B-85(T) EF121853 99.384 |
3樓2012-04-15 00:11:51
zhr1017
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4樓2014-07-06 11:10:34
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