 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 查看: 4534 | 回復: 35 | ||
西門炊餅鐵蟲 (初入文壇)
|
[求助]
關(guān)于篩選和鑒定細菌(16S rRNA)
|
|
|
目前我的實驗需要將樣品中細菌分離出來并鑒定，希望能分離出我感興趣的菌，如果能發(fā)現(xiàn)新細菌就更好了，對于如何篩選和鑒定，我有這樣的難題： 感覺用Vitek-2自動分析儀鑒定菌工作量太大，而且費時間，首先得將樣品用幾種增菌液增菌，然后增菌液又劃到幾種篩選平板上，平板上挑單菌落劃線，接種3代以上純化，然后革蘭氏染色（這步工作量大），最后拿去全自動微生物分析儀上去分析，鑒定卡貴，還不一定能全給鑒定出來，忒麻煩。往往一天要劃上百塊平板，如果做得多，更恐怖。 我的目的是篩菌，理想結(jié)果是篩到我感興趣的菌，或者是新細菌�，F(xiàn)在琢磨著用擴增16S rRNA，然后去測序的方法來篩菌，最后再拿去微生物自動分析，這樣篩到新細菌的可能性大。我準備這么做，開始的步驟一樣，首先得將樣品用幾種增菌液增菌，然后增菌液又劃到幾種篩選平板上，這時不挑單菌落純化了，直接將篩選平板上的有代表性的單菌落（初步定為一塊板10個左右，用以前的辦法只能挑1-3個，不然工作量會嚇死人）挑到盛有營養(yǎng)肉湯的EP管里去搖，搖好了后直接拿去菌液PCR，引物用16S rRNA的通用引物，擴增好了就送去測序。 不知道這樣的方法是否可行，敬請高人指點，懇請大家暢所欲言。我知道這個方法存在的一個問題：首先，我挑到的單菌落有可能不是單種細菌，可能是兩種甚至多種細菌，這樣菌液PCR擴增出來的就不是一種片段，而是幾種片段，由于我不太清楚測序的過程，這種情況下測序會測出什么結(jié)果我也無法預計。強調(diào)一點：我的目的是篩菌，不是一定要把每個都準確的測出來。 [ Last edited by 西門炊餅 on 2011-8-29 at 13:54 ] |
回復此樓» 猜你喜歡
281求調(diào)劑（0805）
已經(jīng)有8人回復
-
環(huán)境領(lǐng)域全國重點實驗室招收博士1-2名
已經(jīng)有3人回復
-
材料專碩306英一數(shù)二
已經(jīng)有10人回復
-
301求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復
-
一志愿天津大學化學工藝專業(yè)（081702）315分求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復
-
302求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復
-
26博士申請
已經(jīng)有3人回復
-
268求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復
-
311求調(diào)劑
已經(jīng)有10人回復
-
被我言中：新模板不強調(diào)格式了，假專家開始管格式了
已經(jīng)有4人回復
» 本主題相關(guān)價值貼推薦，對您同樣有幫助:
- 如何從土壤中篩選酵母菌株，并進行相關(guān)鑒定？
已經(jīng)有22人回復
- 菌種鑒定怎樣選取培養(yǎng)基
已經(jīng)有6人回復
- 微生物多樣性研究的幾個問題
已經(jīng)有10人回復
- 求幫忙分析下菌液PCR檢測結(jié)果
已經(jīng)有19人回復
- 求助高人，篩菌問題，怎么選擇鑒別培養(yǎng)基
已經(jīng)有5人回復
- 關(guān)于菌株16SrDNA序列鑒定的問題
已經(jīng)有4人回復
- 在基因重組過程中，怎樣鑒別質(zhì)粒載體是否被限制性內(nèi)切酶切好？
已經(jīng)有10人回復
- 細菌篩選鑒定的文章，比較容易發(fā)的SCI雜志有哪些
已經(jīng)有3人回復
| 你好，微生物分離鑒定可分為可培養(yǎng)微生物鑒定和不可培養(yǎng)微生物鑒定�？膳囵B(yǎng)法是需要必須經(jīng)過細心培養(yǎng)和純化。而不可培養(yǎng)法不需要分離，只是把總DNA提取進行PAGE電泳即可得到樣品中的細菌類型。但不能獲得菌落的信息。從你的描述來看你是想做可培養(yǎng)細菌的鑒定，那么必須經(jīng)過細心培養(yǎng)，純化和鑒定。如果你的目的是分離有意義的細菌那么要用兩種以上的培養(yǎng)基，覺得工作量多可選擇一種培養(yǎng)基（注意不要用LB和TSA培養(yǎng)基），最好是適合你的樣品生長的培養(yǎng)基（需自己查資料）。另外我建議你你所說的VITEK2，COMPAT等儀器是人體微生物檢驗專用，含有少數(shù)工業(yè)微生物，不適合土壤微生物。所以你要考慮你的樣品和你想獲得什么類型的微生物。 |
16樓2011-09-02 01:47:15
yemuren
鐵桿木蟲 (正式寫手)
- MicEPI: 1
- 應助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 9352.9
- 散金: 20
- 帖子: 325
- 在線: 2370.2小時
- 蟲號: 926290
- 注冊: 2009-12-12
- 性別: GG
- 專業(yè): 生物大分子結(jié)構(gòu)與功能
12樓2011-08-31 10:38:35
粉靛藍
木蟲 (著名寫手)
- 應助: 31 (小學生)
- 金幣: 2812.5
- 散金: 564
- 紅花: 5
- 帖子: 1145
- 在線: 398小時
- 蟲號: 764757
- 注冊: 2009-05-07
- 專業(yè): 食品科學
2樓2011-08-29 15:50:53
西門炊餅
鐵蟲 (初入文壇)
- 應助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 53.5
- 帖子: 26
- 在線: 12.6小時
- 蟲號: 1382807
- 注冊: 2011-08-29
- 性別: GG
- 專業(yè): 病原細菌與放線菌生物學
3樓2011-08-29 16:40:50
粉靛藍
木蟲 (著名寫手)
- 應助: 31 (小學生)
- 金幣: 2812.5
- 散金: 564
- 紅花: 5
- 帖子: 1145
- 在線: 398小時
- 蟲號: 764757
- 注冊: 2009-05-07
- 專業(yè): 食品科學
4樓2011-08-29 16:47:30
5樓2011-08-29 21:25:56
aegeansea
金蟲 (小有名氣)
- 應助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 394.5
- 散金: 18
- 帖子: 108
- 在線: 61小時
- 蟲號: 459531
- 注冊: 2007-11-14
- 專業(yè): 病原細菌與放線菌生物學
6樓2011-08-30 11:26:58
quiller2000
木蟲 (著名寫手)
- MicEPI: 3
- 應助: 160 (高中生)
- 貴賓: 0.114
- 金幣: 2752.9
- 散金: 50
- 紅花: 26
- 帖子: 1168
- 在線: 167.3小時
- 蟲號: 895537
- 注冊: 2009-11-06
- 性別: GG
- 專業(yè): 微生物資源與分類學
7樓2011-08-30 23:27:17
西門炊餅
鐵蟲 (初入文壇)
- 應助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 53.5
- 帖子: 26
- 在線: 12.6小時
- 蟲號: 1382807
- 注冊: 2011-08-29
- 性別: GG
- 專業(yè): 病原細菌與放線菌生物學
8樓2011-08-31 08:49:51
西門炊餅
鐵蟲 (初入文壇)
- 應助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 53.5
- 帖子: 26
- 在線: 12.6小時
- 蟲號: 1382807
- 注冊: 2011-08-29
- 性別: GG
- 專業(yè): 病原細菌與放線菌生物學
9樓2011-08-31 08:53:32
西門炊餅
鐵蟲 (初入文壇)
- 應助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 53.5
- 帖子: 26
- 在線: 12.6小時
- 蟲號: 1382807
- 注冊: 2011-08-29
- 性別: GG
- 專業(yè): 病原細菌與放線菌生物學
10樓2011-08-31 08:54:18
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 西門炊餅 的主題更新
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考博] 26博士申請 +3 | 1042136743 2026-03-17 | 3/150 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 303求調(diào)劑 +3 | 睿08 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 0703化學336分求調(diào)劑 +4 | zbzihdhd 2026-03-15 | 5/250 |
|
|
|
[碩博家園] 湖北工業(yè)大學 生命科學與健康學院-課題組招收2026級食品/生物方向碩士 +3 | 1喜春8 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 085600材料與化工 +4 | 安全上岸！ 2026-03-16 | 4/200 |
|
|
|
[考博] 26申博 +4 | 八旬速覽 2026-03-16 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 289求調(diào)劑 +6 | 步川酷紫123 2026-03-11 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 311求調(diào)劑 +5 | 26研0 2026-03-15 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 085600調(diào)劑 +5 | 漾漾123sun 2026-03-12 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 一志愿華中師范071000，325求調(diào)劑 +6 | RuitingC 2026-03-12 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 070303 總分349求調(diào)劑 +3 | LJY9966 2026-03-15 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 327求調(diào)劑 +6 | 拾光任染 2026-03-15 | 11/550 |
|
|
|
[考研]
 機械專碩調(diào)劑
+3
|
笨笨兔子 2026-03-12 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 294求調(diào)劑 +3 | Zys010410@ 2026-03-13 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 080500，材料學碩302分求調(diào)劑學校 +4 | 初識可樂 2026-03-14 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 337一志愿華南理工0805材料求調(diào)劑 +7 | mysdl 2026-03-11 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 308求調(diào)劑 +5 | 是Lupa啊 2026-03-11 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 314求調(diào)劑 +7 | 無懈可擊的巨人 2026-03-12 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 0817化學工程與技術(shù)考研312分調(diào)劑 +3 | T123 tt 2026-03-12 | 3/150 |
|
|
|
[考博] 福州大學楊黃浩課題組招收2026年專業(yè)學位博士研究生，2026.03.20截止 +3 | Xiangyu_ou 2026-03-12 | 3/150 |
|