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cenwanglai榮譽版主 (知名作家)
老和山猥瑣派九段
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[求助]
跑第一性原理分子動力學用配多大的計算硬件？
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以前是做第一性原理結構優(yōu)化和靜態(tài)性質計算，一般100核以內就可以基本滿足要求。 現在想關第一性原理分子動力學（BOMD&CPMD）。希望給個概念： （1）第一性原理分子動力學現在一般（非做方法，只是應用）跑多少個原子的體系； （2）就上海超算中心的配置來講，需要租用多少個核。 |
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goldenfisher
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【答案】應助回帖
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| 這取決于你做多大的體系，然后再取決于你研究什么性質。如果你只是研究常溫或者熔化溫度左右的溫度，且體系也在100個原子左右，那你之前的機器也夠用了。但是，ABMD需要的時間很長，一般至少幾天以上。所以，如果你要同時跑很多作業(yè)，那就得多要節(jié)點了。我通常做凝聚態(tài)范圍內的MD的話，一百個原子左右，且不包含稀有金屬等電子很多的體系，我每個左右32-64個節(jié)點足夠。有些大的體系，且計算時間要很長的體系，需要128-256個核。所以，你自己可以估量一下。 |
2樓2012-04-24 12:23:13
goldenfisher
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3樓2012-04-24 12:23:56
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