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木蟲 (正式寫手)

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[求助] vasp5.2計算E-V曲線

最近將vasp4.6，換成了5.2，采用4.6計算E-V曲線的腳本文件run文件不能在5.2上運行，是因為5.2更新了腳本文件還是由于其它原因造成的？望各位蟲友不吝賜教啊，小弟感激不盡

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1樓 2012-05-03 18:22:11

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fzx2008

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【答案】應(yīng)助回帖

★
sunyang1988: 金幣+1, 謝謝幫助 2012-05-04 12:04:59
yi315730581: 回帖置頂 2012-05-04 14:44:29

回復(fù)樓上
在你的機器上，vasp4.6和vasp的5.2的可執(zhí)行文件名肯定不一樣，或者路徑不一樣，對應(yīng)你腳本的倒數(shù)第四行，檢查一下

你的LOG文件表明，根本就還沒有執(zhí)行vasp的計算，故沒有OSZICAR的產(chǎn)生

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5樓2012-05-04 10:12:14

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請給出更多的信息以便大家更好的幫助你：
  你所使用的腳本文件內(nèi)容
  你的INCAR文件內(nèi)容
  運行后stdout和stderr內(nèi)容（如果是集群，為xxx.exxx和xxx.oxxx兩個文件）

CODE:

tail OUTCAR

結(jié)果

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2樓2012-05-03 18:28:16

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【答案】應(yīng)助回帖

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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
liliangfang: 金幣+1, 多謝指教 2012-05-04 08:52:29

兩個版本
確實有些地方有些不同
需要根據(jù)實際情況來修正一下腳本

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3樓2012-05-04 00:14:17

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yi315730581

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引用回帖:

3樓: Originally posted by fzx2008 at 2012-05-04 00:14:17:
兩個版本
確實有些地方有些不同
需要根據(jù)實際情況來修正一下腳本

下面是計算時LOG文件提示
a= -252
./run: line 39: vasp: command not found
tail: 無法打開"OSZICAR" 讀取數(shù)據(jù): 沒有那個文件或目錄
a= -254
./run: line 39: vasp: command not found
tail: 無法打開"OSZICAR" 讀取數(shù)據(jù): 沒有那個文件或目錄
a= -256
./run: line 39: vasp: command not found
tail: 無法打開"OSZICAR" 讀取數(shù)據(jù): 沒有那個文件或目錄
a= -258
./run: line 39: vasp: command not found
tail: 無法打開"OSZICAR" 讀取數(shù)據(jù): 沒有那個文件或目錄
a= -260
如果要進行修正，您是否知道E-V腳本如何修正，
這是4.6里面的run腳本文件，在5.2要怎么改呢？
for a in -276 -278 -280 -282 -284 -286 -288 -290 -292
do
echo "a= $a"

cat >POSCAR <   system=Sm2O3-mc
$a ! opt v=284.34
9.4358829241445026 0.0093440932014115 0.0000000000000000
   0.0093440932014115 9.4358829241445026 0.0000000000000000
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  0.6531878634866803  0.1444463382096187  0.0000000000000000
  0.1444463382096187  0.6531878634866803  0.0000000000000000
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  0.8531303382625581  0.8531303382625581  0.0000000000000000
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  0.5993688875309738  0.4006311124690261  0.5000000000000000
  0.0871025219522729  0.9128974780477273  0.5000000000000000
  0.5876280207777420  0.9100961576735108  0.5000000000000000
!

vasp

E=`tail -1 OSZICAR`
echo $a $E >>SUMMARY

done

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4樓2012-05-04 09:57:09

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franch: 專家考核 2012-05-07 12:36:47
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首先，是你的環(huán)境變量有問題，至少系統(tǒng)找不到vasp這個可執(zhí)行文件。
其次，我覺得你的腳本也有我問題，a應(yīng)該是長度單位，那么280A實在太大了，我懷疑是2.82這個量級才對，或284這個應(yīng)該優(yōu)化之后的體積

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6樓2012-05-05 06:11:26

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vasp這一行有問題

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