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yi315730581

木蟲 (正式寫手)

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[求助] vasp5.2計(jì)算E-V曲線

最近將vasp4.6，換成了5.2，采用4.6計(jì)算E-V曲線的腳本文件run文件不能在5.2上運(yùn)行，是因?yàn)?.2更新了腳本文件還是由于其它原因造成的？望各位蟲友不吝賜教啊，小弟感激不盡

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1樓 2012-05-03 18:22:11

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fzx2008

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liliangfang: 金幣+1, 多謝指教 2012-05-04 08:52:29

兩個(gè)版本
確實(shí)有些地方有些不同
需要根據(jù)實(shí)際情況來修正一下腳本

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3樓2012-05-04 00:14:17

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  你所使用的腳本文件內(nèi)容
  你的INCAR文件內(nèi)容
  運(yùn)行后stdout和stderr內(nèi)容（如果是集群，為xxx.exxx和xxx.oxxx兩個(gè)文件）

CODE:

tail OUTCAR

結(jié)果

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2樓2012-05-03 18:28:16

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引用回帖:

3樓: Originally posted by fzx2008 at 2012-05-04 00:14:17:
兩個(gè)版本
確實(shí)有些地方有些不同
需要根據(jù)實(shí)際情況來修正一下腳本

下面是計(jì)算時(shí)LOG文件提示
a= -252
./run: line 39: vasp: command not found
tail: 無法打開"OSZICAR" 讀取數(shù)據(jù): 沒有那個(gè)文件或目錄
a= -254
./run: line 39: vasp: command not found
tail: 無法打開"OSZICAR" 讀取數(shù)據(jù): 沒有那個(gè)文件或目錄
a= -256
./run: line 39: vasp: command not found
tail: 無法打開"OSZICAR" 讀取數(shù)據(jù): 沒有那個(gè)文件或目錄
a= -258
./run: line 39: vasp: command not found
tail: 無法打開"OSZICAR" 讀取數(shù)據(jù): 沒有那個(gè)文件或目錄
a= -260
如果要進(jìn)行修正，您是否知道E-V腳本如何修正，
這是4.6里面的run腳本文件，在5.2要怎么改呢？
for a in -276 -278 -280 -282 -284 -286 -288 -290 -292
do
echo "a= $a"

cat >POSCAR <   system=Sm2O3-mc
$a ! opt v=284.34
9.4358829241445026 0.0093440932014115 0.0000000000000000
   0.0093440932014115 9.4358829241445026 0.0000000000000000
   0.0000000000000000 0.0000000000000000 3.1935538427218289
3 5  16
Direct
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  0.6558114838898069  0.6558114838898069  0.0000000000000000
  0.3441883509131848  0.3441883509131848  0.0000000000000000
  0.8555536617903814  0.3468121365133194  0.0000000000000000
  0.3468121365133194  0.8555536617903814  0.0000000000000000
  0.8531303382625581  0.8531303382625581  0.0000000000000000
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  0.0899036771294812  0.4123719444192637  0.5000000000000000
  0.5993688875309738  0.4006311124690261  0.5000000000000000
  0.0871025219522729  0.9128974780477273  0.5000000000000000
  0.5876280207777420  0.9100961576735108  0.5000000000000000
!

vasp

E=`tail -1 OSZICAR`
echo $a $E >>SUMMARY

done

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4樓2012-05-04 09:57:09

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【答案】應(yīng)助回帖

★
sunyang1988: 金幣+1, 謝謝幫助 2012-05-04 12:04:59
yi315730581: 回帖置頂 2012-05-04 14:44:29

回復(fù)樓上
在你的機(jī)器上，vasp4.6和vasp的5.2的可執(zhí)行文件名肯定不一樣，或者路徑不一樣，對(duì)應(yīng)你腳本的倒數(shù)第四行，檢查一下

你的LOG文件表明，根本就還沒有執(zhí)行vasp的計(jì)算，故沒有OSZICAR的產(chǎn)生

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回復(fù)此樓

5樓2012-05-04 10:12:14

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