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洪瑞金蟲 (小有名氣)
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[求助]
藥物篩選 中STD 和 Water-LOGSY 講的 是什么?
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| 藥物篩選 中STD 和 Water-LOGSY 講的 是什么意思? 多謝指教 |
主管區(qū)長 (職業(yè)作家)
制粒能手
| WaterLOGSY (Water–ligand observed via gradient)方法在藥物初級篩選非常有效。與STD不同的是WaterLOGSY方法選擇性飽和的是水分子而不是蛋白上的質(zhì)子。由于大量的水分子通過各種與蛋白的相互作用停留在蛋白表面,所以當我們選擇性飽和照射水分子時,飽和會轉(zhuǎn)移到蛋白上,再經(jīng)自旋擴散,飽和進一步轉(zhuǎn)移到整個配體-蛋白復(fù)合物;通過結(jié)合態(tài)和游離態(tài)配體的化學(xué)交換,飽和轉(zhuǎn)移到自由態(tài)配體。由于自由態(tài)配體的NOE 信號往往為小的正值,而束縛態(tài)配體的NOE 信號往往為大的負值,當選擇性地激發(fā)水信號,對能與蛋白質(zhì)結(jié)合的配體而言,水磁化轉(zhuǎn)移途徑為體水→蛋白質(zhì)-配體復(fù)合物→自由態(tài)配體,這時配體對應(yīng)較大的負NOE 信號;而對不與蛋白質(zhì)結(jié)合的配體而言,水磁化轉(zhuǎn)移途徑為體水→自由態(tài)配體, 這時配體對應(yīng)小的正NOE 信號,即能與蛋白質(zhì)結(jié)合的配體NMR 信號與不能結(jié)合的配體NMR 信號符號相反,從而得以篩選出能與蛋白質(zhì)發(fā)生相互作用的配體。 |

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