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洪瑞金蟲(chóng) (小有名氣)
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[求助]
藥物篩選 中STD 和 Water-LOGSY 講的 是什么？
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| 藥物篩選 中STD 和 Water-LOGSY 講的 是什么意思？ 多謝指教 |
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豆哥
主管區(qū)長(zhǎng) (職業(yè)作家)
制粒能手
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- 性別: GG
- 專業(yè): 中藥制劑
【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
| WaterLOGSY (Water–ligand observed via gradient)方法在藥物初級(jí)篩選非常有效。與STD不同的是WaterLOGSY方法選擇性飽和的是水分子而不是蛋白上的質(zhì)子。由于大量的水分子通過(guò)各種與蛋白的相互作用停留在蛋白表面，所以當(dāng)我們選擇性飽和照射水分子時(shí)，飽和會(huì)轉(zhuǎn)移到蛋白上，再經(jīng)自旋擴(kuò)散，飽和進(jìn)一步轉(zhuǎn)移到整個(gè)配體－蛋白復(fù)合物；通過(guò)結(jié)合態(tài)和游離態(tài)配體的化學(xué)交換，飽和轉(zhuǎn)移到自由態(tài)配體。由于自由態(tài)配體的NOE 信號(hào)往往為小的正值，而束縛態(tài)配體的NOE 信號(hào)往往為大的負(fù)值，當(dāng)選擇性地激發(fā)水信號(hào)，對(duì)能與蛋白質(zhì)結(jié)合的配體而言，水磁化轉(zhuǎn)移途徑為體水→蛋白質(zhì)－配體復(fù)合物→自由態(tài)配體，這時(shí)配體對(duì)應(yīng)較大的負(fù)NOE 信號(hào)；而對(duì)不與蛋白質(zhì)結(jié)合的配體而言，水磁化轉(zhuǎn)移途徑為體水→自由態(tài)配體, 這時(shí)配體對(duì)應(yīng)小的正NOE 信號(hào)，即能與蛋白質(zhì)結(jié)合的配體NMR 信號(hào)與不能結(jié)合的配體NMR 信號(hào)符號(hào)相反，從而得以篩選出能與蛋白質(zhì)發(fā)生相互作用的配體。 |
2樓2012-05-10 09:32:59
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