 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 4391 | 回復(fù): 5 | ||
| 當(dāng)前只顯示滿足指定條件的回帖，點(diǎn)擊這里查看本話題的所有回帖 | ||
[求助]
如何計(jì)算 兩個(gè)原子間距離隨時(shí)間的變化以及距離的分布
|
||
|
看文獻(xiàn)中有end to end distance，也想做一下聚合物分子鏈兩頭的距離隨時(shí)間的變化，以及距離的分布 看手冊(cè)使用這個(gè)命令： g_dist -f traj.trr -s topol.tpr -n bond.ndx -o dist.xvg bond.ndx這樣寫： [ bond ] 1 50 （測量atom1和atom50之間的距離） 但是輸出的dist.xvg的函數(shù)值都是0，不知道我的問題出在哪里了？ 我也試過g_bond，這個(gè)命令好像只能測量鍵長，即相鄰原子的距離。 |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
805600專碩材料與化工348分求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
重慶大學(xué)材料與化工085600，初試370+，求求調(diào)劑建議
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
309求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
一志愿北交大材料工程，總分358
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
302求調(diào)劑一志愿北航070300，本科鄭大化學(xué)
已經(jīng)有11人回復(fù)
-
化學(xué)工程專碩324分，一志愿中國礦業(yè)大學(xué)求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
材料求調(diào)劑
已經(jīng)有11人回復(fù)
-
【求調(diào)劑】新能源材料本科，一志愿211，初試321
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
336求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
材料求調(diào)劑
已經(jīng)有8人回復(fù)
» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- 分子動(dòng)力學(xué)中計(jì)算出的原子總能和原子的電離能比較可以判斷原子是否發(fā)生電離嗎
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 求助：計(jì)算兩個(gè)原子之間的距離
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 【急】距離該服從何種分布呢
已經(jīng)有24人回復(fù)
- 用Gaussian做兩個(gè)CH4分子間的勢能面掃描，但結(jié)果不是傳說中的12－6函數(shù)的圖形。
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 如何計(jì)算晶體中兩平面間的距離
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 單個(gè)過渡金屬原子吸附的時(shí)候是否要采用GGA+U，Ｕ值如何確定？
已經(jīng)有4人回復(fù)
- MaterialsStudio中如何畫出任意兩個(gè)原子之間的連線
已經(jīng)有5人回復(fù)
- Materials Studio中設(shè)置原子間的距離為定值
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 什么軟件可以計(jì)算出 分子中原子的幾何位置呀？（原子坐標(biāo)數(shù)據(jù)）
已經(jīng)有5人回復(fù)
- lammps計(jì)算中出現(xiàn)原子距離太近現(xiàn)象
已經(jīng)有11人回復(fù)
- 高斯優(yōu)化后兩個(gè)碳原子之間的距離成為1.668埃，是不是兩者之間肯定不能成鍵？
已經(jīng)有20人回復(fù)
- 如何用shelxl 計(jì)算兩原子間距離
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 做scan時(shí)怎么保持兩個(gè)原子間鍵長不變
已經(jīng)有7人回復(fù)
- material studio中如何拉伸原子之間的鍵長
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 如何計(jì)算點(diǎn)到面與面到面的距離和相關(guān)偏差？
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 求助如何固定原子坐標(biāo)進(jìn)行優(yōu)化，快搞瘋了
已經(jīng)有16人回復(fù)
- 兩個(gè)表面之間作用能或原子吸附能的計(jì)算疑惑
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 用vesta算原子間距離準(zhǔn)確嗎？
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 【求助】怎么算出兩個(gè)環(huán)之間的質(zhì)心（面心）間的距離？
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 【求助】計(jì)算兩原子間距離
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 【求助】怎樣固定原子和距離
已經(jīng)有14人回復(fù)
4樓2012-05-18 11:48:35
sheva7love
銅蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 3 (幼兒園)
- 金幣: 231.4
- 帖子: 57
- 在線: 97.2小時(shí)
- 蟲號(hào): 1458206
- 注冊(cè): 2011-10-24
- 專業(yè): 傳熱傳質(zhì)學(xué)
2樓2012-05-18 11:07:49
3樓2012-05-18 11:25:39
kindermoon
木蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 6 (幼兒園)
- 金幣: 6875.6
- 紅花: 3
- 帖子: 91
- 在線: 593.4小時(shí)
- 蟲號(hào): 831472
- 注冊(cè): 2009-08-20
- 性別: GG
- 專業(yè): 生物物理化學(xué)
5樓2012-05-19 05:10:29
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 265求調(diào)劑 +4 | 林深溫瀾 2026-04-01 | 6/300 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 266分，一志愿電氣工程，本科材料，求材料專業(yè)調(diào)劑 +8 | 哇呼哼呼哼 2026-04-01 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 070300化學(xué)279求調(diào)劑 +15 | 哈哈哈^_^ 2026-03-31 | 17/850 |
|
|
|
[考研] 26考研調(diào)劑 +3 | Wnz.20030617 2026-04-01 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0703一志愿南師大334求調(diào)劑 +4 | seven7yu 2026-03-30 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +4 | 圖鑒212 2026-03-30 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 283求調(diào)劑 +9 | A child 2026-03-28 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 材料調(diào)劑 +11 | 一樣YWY 2026-03-31 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 358求調(diào)劑 +3 | 王向陽花 2026-03-31 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0856材料與化工調(diào)劑，339 +10 | 10213207 2026-03-31 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 086000調(diào)劑 +5 | 7901117076 2026-03-26 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 080500-315分復(fù)試調(diào)劑 +9 | 上岸3821 2026-03-31 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 340求調(diào)劑 +4 | 希望如此i 2026-03-31 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 本科211生物醫(yī)學(xué)工程085409求調(diào)劑339分 +7 | 里子木yy 2026-03-29 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 生物考研337分求調(diào)劑 +4 | cgxin 2026-03-30 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 322求調(diào)劑 +10 | 宋明欣 2026-03-27 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 293求調(diào)劑 +3 | 末未mm 2026-03-30 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 310求調(diào)劑 +10 | 爭取九點(diǎn)睡 2026-03-30 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 環(huán)境科學(xué)與工程334分求調(diào)劑 +6 | 王一一依依 2026-03-30 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 本科雙非材料，跨考一志愿華電085801電氣，283求調(diào)劑，任何專業(yè)都可以 +6 | 芝士雪baoo 2026-03-28 | 8/400 |
|