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[求助]
如何計(jì)算 兩個(gè)原子間距離隨時(shí)間的變化以及距離的分布
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看文獻(xiàn)中有end to end distance，也想做一下聚合物分子鏈兩頭的距離隨時(shí)間的變化，以及距離的分布 看手冊(cè)使用這個(gè)命令： g_dist -f traj.trr -s topol.tpr -n bond.ndx -o dist.xvg bond.ndx這樣寫： [ bond ] 1 50 （測(cè)量atom1和atom50之間的距離） 但是輸出的dist.xvg的函數(shù)值都是0，不知道我的問題出在哪里了？ 我也試過g_bond，這個(gè)命令好像只能測(cè)量鍵長(zhǎng)，即相鄰原子的距離。 |
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