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bizi294金蟲 (正式寫手)
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[求助]
如何計(jì)算molecular surface area
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| 最近遇到一個(gè)問題，需要計(jì)算一個(gè)分子的升華焓，查詢文獻(xiàn)，發(fā)現(xiàn)有一種方法是通過(guò)靜電勢(shì)參數(shù)和分子表面積獲得的。首先定義一個(gè)分子表面，即0.001 au包圍的等值面，這個(gè)面上的靜電勢(shì)參數(shù)會(huì)計(jì)算，但是這個(gè)面的面積該如何計(jì)算�。客呤謧儾涣哔n教！包括用到的軟件，處理方法等。 |
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已經(jīng)有161人回復(fù)
2樓2012-06-04 20:56:15
sobereva
至尊木蟲 (著名寫手)
本人已永久離開小木蟲
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
bizi294: 金幣+120, ★★★★★最佳答案, 多謝 2012-06-05 21:07:48
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bizi294: 金幣+120, ★★★★★最佳答案, 多謝 2012-06-05 21:07:48
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能計(jì)算分子表面積的軟件多得很，比如VMD、chem3D、materialstudio等等。 Multiwfn也能計(jì)算分子表面積。如果你還需要計(jì)算和靜電勢(shì)有關(guān)的特殊的面積，比如靜電勢(shì)為正值/負(fù)值區(qū)域的面積，那么據(jù)我所知能公開下載的免費(fèi)程序里也只有Multiwfn能算�？梢詤⒖际謨�(cè)4.12節(jié)的例子。 |
3樓2012-06-05 06:17:44
4樓2012-06-05 21:34:10
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