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bizi294金蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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[求助]
如何計(jì)算molecular surface area
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| 最近遇到一個(gè)問(wèn)題,需要計(jì)算一個(gè)分子的升華焓,查詢文獻(xiàn),發(fā)現(xiàn)有一種方法是通過(guò)靜電勢(shì)參數(shù)和分子表面積獲得的。首先定義一個(gè)分子表面,即0.001 au包圍的等值面,這個(gè)面上的靜電勢(shì)參數(shù)會(huì)計(jì)算,但是這個(gè)面的面積該如何計(jì)算?望高手們不吝賜教!包括用到的軟件,處理方法等。 |
至尊木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
本人已永久離開(kāi)小木蟲(chóng)
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能計(jì)算分子表面積的軟件多得很,比如VMD、chem3D、materialstudio等等。 Multiwfn也能計(jì)算分子表面積。如果你還需要計(jì)算和靜電勢(shì)有關(guān)的特殊的面積,比如靜電勢(shì)為正值/負(fù)值區(qū)域的面積,那么據(jù)我所知能公開(kāi)下載的免費(fèi)程序里也只有Multiwfn能算?梢詤⒖际謨(cè)4.12節(jié)的例子。 |
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