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bizi294金蟲 (正式寫手)
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[求助]
如何計算molecular surface area
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| 最近遇到一個問題，需要計算一個分子的升華焓，查詢文獻，發(fā)現(xiàn)有一種方法是通過靜電勢參數(shù)和分子表面積獲得的。首先定義一個分子表面，即0.001 au包圍的等值面，這個面上的靜電勢參數(shù)會計算，但是這個面的面積該如何計算��？望高手們不吝賜教！包括用到的軟件，處理方法等。 |
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sobereva
至尊木蟲 (著名寫手)
本人已永久離開小木蟲
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
bizi294: 金幣+120, ★★★★★最佳答案, 多謝 2012-06-05 21:07:48
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bizi294: 金幣+120, ★★★★★最佳答案, 多謝 2012-06-05 21:07:48
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能計算分子表面積的軟件多得很，比如VMD、chem3D、materialstudio等等。 Multiwfn也能計算分子表面積。如果你還需要計算和靜電勢有關(guān)的特殊的面積，比如靜電勢為正值/負值區(qū)域的面積，那么據(jù)我所知能公開下載的免費程序里也只有Multiwfn能算�？梢詤⒖际謨�4.12節(jié)的例子。 |
3樓2012-06-05 06:17:44
2樓2012-06-04 20:56:15
4樓2012-06-05 21:34:10
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