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beer胖新蟲(chóng) (小有名氣)
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[求助]
基因測(cè)序結(jié)果比對(duì) 已有2人參與
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本人最近按照ncbi上blast 到的S288c菌株的一個(gè)基因設(shè)計(jì)引物，擴(kuò)增了一株釀酒酵母的該基因，送樣7個(gè)轉(zhuǎn)化子進(jìn)行測(cè)序，結(jié)果顯示老是有個(gè)別基因與S288c的不一致：1.7kb的片段有12個(gè)單堿基不一致，核對(duì)了翻譯的氨基酸，有四個(gè)氨基酸與S288c的不一致，而且這7個(gè)測(cè)序結(jié)果彼此也不一樣。 我想問(wèn)一下，這樣的測(cè)序結(jié)果能不能認(rèn)為與S288c的基因一致。 |
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beer胖2樓2012-06-06 11:07:54
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【答案】應(yīng)助回帖
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西門(mén)吹雪170: 金幣+2, 鼓勵(lì)回帖交流 2014-03-07 10:12:20
西門(mén)吹雪170: 金幣+2, 鼓勵(lì)回帖交流 2014-03-07 10:12:20
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測(cè)序出現(xiàn)個(gè)別堿基不同是很正常的，有三種可能：1、PCR擴(kuò)增過(guò)程中出現(xiàn)錯(cuò)誤，你的片段1.7kb如果用普通taq酶出現(xiàn)幾個(gè)錯(cuò)配很有可能。2、測(cè)序過(guò)程中的，具體可以看看峰圖，有可能信號(hào)不強(qiáng)烈造成判斷失誤。3、那就是真的出現(xiàn)突變。 對(duì)于第二種情況，我在擴(kuò)增一個(gè)小鼠的基因時(shí)也遇到過(guò)，不知道你這個(gè)菌是不是真菌，如果是的話，那就是內(nèi)含子切除的時(shí)候發(fā)生可變剪接，多了12個(gè)堿基，但是不影響后面氨基酸的序列，功能上應(yīng)該不會(huì)有太大的變化。 |
6樓2014-03-07 10:05:17
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