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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 計算模擬區(qū) » 量子化學 » NBO/AIM » AIM計算氫鍵的八個指標求助
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[求助]
AIM計算氫鍵的八個指標求助 已有1人參與
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| AIM計算氫鍵有八個指標分別是標準如下所述：(1)正確的拓撲類型 (即存在一個鍵的臨界點(BCP)和一條鍵徑)；(2)在此BCP處適當的電子密度值，約在0.002到0.035 au之間；(3)在此BCP處電子密度的Laplacian值在0.024到0.139 au之間；(4)H和Y原子的相互滲透；(5)氫原子凈電荷的增加；(6)氫原子的能量增高；(7)偶極極化的降低；(8)氫原子的原子體積減小。第四個指標是在搞不清楚說是非鍵半徑減去成鍵半徑，成鍵半徑是原子到臨界點的距離，那請問非鍵半徑咋辦文獻是這么說的，非鍵原子半徑則為在此氫鍵方向上原子與一條等密度線(此處我們取為0.001 au)之間的距離，但實際上怎么操作。盼高手解答！��！ |
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sobereva
至尊木蟲 (著名寫手)
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gmy1990: 金幣+3 2014-09-14 06:49:27
gmy1990: 金幣+3 2014-09-14 06:49:27
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參見此文第12小節(jié) Multiwfn支持的弱相互作用的分析方法概覽 http://hi.baidu.com/sobereva/item/932f96260c57eaf951fd8716 以及此文的第六節(jié) 使用Multiwfn結合VMD分析和繪制分子表面靜電勢分布 http://hi.baidu.com/sobereva/item/692f9a83d8e9a5c8b071545d |
4樓2014-09-13 23:09:13
2樓2012-06-07 11:00:11
shangwu
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- 專業(yè): 有機分子功能材料化學
3樓2014-09-13 10:11:10
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