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chip實(shí)驗(yàn)超聲問(wèn)題 已有2人參與
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大家好： 我所做細(xì)菌蛋白的chip實(shí)驗(yàn)。本實(shí)驗(yàn)的目的是用已獲得的細(xì)菌蛋白鼠單抗，通過(guò)chip實(shí)驗(yàn)方法（用的是millipore的EZ-CHIP試劑盒），來(lái)篩選細(xì)菌體內(nèi)可能與該蛋白有直接作用的DNA片段。 前2次做chip實(shí)驗(yàn)是2011年12月，實(shí)驗(yàn)還算順利進(jìn)行吧。超聲破碎是該實(shí)驗(yàn)的重點(diǎn)，超聲波把基因組打斷為100-1000bp左右大小的片段。我前2次，用chip實(shí)驗(yàn)2%瓊脂糖膠電泳超聲波打斷后的DNA片段，發(fā)現(xiàn)其DNA條帶大小在100-500bp左右。 但是今天即2012-6-8重復(fù)該實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)--超聲破碎這步出現(xiàn)嚴(yán)重問(wèn)題：1、用2ml EP管中有1ml的樣品用小探頭超聲破碎，結(jié)果超聲不足5個(gè)間隔就產(chǎn)生大量泡沫。 2、超聲間隔為40s，超聲5s；但是泡沫依然很多；3、在冰上超聲，冰極易溶化，EP管位置可能有變化，探頭碰壁；后用冰盒固定EP管，探頭未碰壁，依然會(huì)產(chǎn)生很多泡沫。4、電泳發(fā)現(xiàn)，超聲不完全。 所以請(qǐng)教大家提出寶貴意見(jiàn)，如何解決超聲問(wèn)題。謝謝回復(fù) |
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