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[交流]
chip實驗超聲問題 已有2人參與
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大家好： 我所做細菌蛋白的chip實驗。本實驗的目的是用已獲得的細菌蛋白鼠單抗，通過chip實驗方法（用的是millipore的EZ-CHIP試劑盒），來篩選細菌體內(nèi)可能與該蛋白有直接作用的DNA片段。 前2次做chip實驗是2011年12月，實驗還算順利進行吧。超聲破碎是該實驗的重點，超聲波把基因組打斷為100-1000bp左右大小的片段。我前2次，用chip實驗2%瓊脂糖膠電泳超聲波打斷后的DNA片段，發(fā)現(xiàn)其DNA條帶大小在100-500bp左右。 但是今天即2012-6-8重復(fù)該實驗發(fā)現(xiàn)--超聲破碎這步出現(xiàn)嚴(yán)重問題：1、用2ml EP管中有1ml的樣品用小探頭超聲破碎，結(jié)果超聲不足5個間隔就產(chǎn)生大量泡沫。 2、超聲間隔為40s，超聲5s；但是泡沫依然很多；3、在冰上超聲，冰極易溶化，EP管位置可能有變化，探頭碰壁；后用冰盒固定EP管，探頭未碰壁，依然會產(chǎn)生很多泡沫。4、電泳發(fā)現(xiàn)，超聲不完全。 所以請教大家提出寶貴意見，如何解決超聲問題。謝謝回復(fù) |
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