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Discover中Ewald summation和Dynamics times設(shè)定的問題
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在Discover的設(shè)定中可以同時(shí)設(shè)定vdW & Coulomb的summation method 為 Ewald，但是審稿人提出了疑問：How could one use Ewald summation to deal with van der Waals interaction? 這個(gè)該怎么回答？ 另外由200個(gè)小分子組成的體系，設(shè)定Dynamics times為2 ns是否足夠，該如何證明？ |
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chaizhm
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2樓2012-06-13 13:36:49
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謝謝！ 但是在MS的Discover模塊和Forcite模塊中vdW的summation method都可以設(shè)定為Ewald；且附件中的這篇文獻(xiàn)第3頁有一句描述。 分子模擬最后的結(jié)果已經(jīng)符合預(yù)期的設(shè)想，但是審稿人覺得必須要增加時(shí)間，也不知道該加到多少才符合 |
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2012-06-13 15:10:18, 667.94 K
3樓2012-06-13 15:11:14
chaizhm
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5樓2012-06-13 15:59:19
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6樓2012-06-14 08:59:39
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