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dw5601新蟲 (小有名氣)
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[求助]
請(qǐng)問如何進(jìn)行蛋白突變體不同溫度下穩(wěn)定性的分子模擬
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| 小蟲最近在做定點(diǎn)突變提高酶的熱穩(wěn)定性實(shí)驗(yàn)。我先通過蛋白序列比對(duì)找了兩個(gè)突變位點(diǎn)，進(jìn)行了突變，發(fā)現(xiàn)突變后蛋白半衰期（熱穩(wěn)定性）提高了2倍，結(jié)果還行。所以想整理一下資料看看能不能發(fā)個(gè)文章。但是，我發(fā)現(xiàn)，國外好多文章都是先用DS等軟件進(jìn)行分析，找到不穩(wěn)定區(qū)域，然后再找突變位點(diǎn)，并且進(jìn)行MD模擬，計(jì)算不同溫度下的突變體及原來蛋白R(shí)MSD，甚至還計(jì)算單個(gè)殘基的RMSD。這樣寫好像檔次提升了很多。我也想做點(diǎn)這方面的東西，但是不知從何入手。用什么軟件，怎樣操作？請(qǐng)問哪位站友能給小弟指點(diǎn)一下。 |
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dw5601
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2樓2012-06-14 09:41:27
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3樓2012-06-16 00:20:24
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