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320080920001金蟲 (正式寫手)
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[求助]
蛋白分子建模 小分子化合物畫圖 酶與配體的分子模擬
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| 大家好 我是學(xué)生物專業(yè)的 以前沒有接觸過分子計(jì)算模擬 現(xiàn)在想用同源建模拿到我的目的蛋白的近似結(jié)構(gòu),然后用(?不知道用什么軟件)得到我的蛋白特定位點(diǎn)的突變體以及小分子配體的analog的分子文件,然后進(jìn)行對接篩選。不知道怎么做,之前通過swiss-model database做了一下同源建模,然后挑了幾個(gè)突變位點(diǎn),現(xiàn)在在做克隆,但是還是覺得做一下分子對接比較安心,怕以后發(fā)現(xiàn)之前的工作一點(diǎn)意義都沒有。請求幫助啊,我裝了Pymol和DS,但是還不會(huì)用,而且英文教程又太難看懂(看的很慢),不知道有沒有好的例子(文獻(xiàn))或者教程、經(jīng)驗(yàn)可以分享一下? |
金蟲 (正式寫手)
金蟲 (正式寫手)
| 建議你去找一本名字叫《蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測實(shí)驗(yàn)指南》化工出版社岳俊杰編的書,上面有比較簡單的操作方法,此外你再去分子模擬論壇上找一些相關(guān)實(shí)驗(yàn)資料基本就能上手了。 |
金蟲 (正式寫手)
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