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320080920001金蟲 (正式寫手)
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[求助]
蛋白分子建模 小分子化合物畫圖 酶與配體的分子模擬
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| 大家好 我是學(xué)生物專業(yè)的 以前沒有接觸過分子計(jì)算模擬 現(xiàn)在想用同源建模拿到我的目的蛋白的近似結(jié)構(gòu)，然后用（？不知道用什么軟件）得到我的蛋白特定位點(diǎn)的突變體以及小分子配體的analog的分子文件，然后進(jìn)行對接篩選。不知道怎么做，之前通過swiss-model database做了一下同源建模，然后挑了幾個(gè)突變位點(diǎn)，現(xiàn)在在做克隆，但是還是覺得做一下分子對接比較安心，怕以后發(fā)現(xiàn)之前的工作一點(diǎn)意義都沒有。請求幫助啊，我裝了Pymol和DS，但是還不會用，而且英文教程又太難看懂（看的很慢），不知道有沒有好的例子（文獻(xiàn)）或者教程、經(jīng)驗(yàn)可以分享一下？ |
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320080920001
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5樓2012-03-01 00:46:12
【答案】應(yīng)助回帖
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320080920001: 金幣+7, ★★★很有幫助, 但是這本書還是太簡單啊 而且其中的DS是收費(fèi)軟件的說 簡直是在打廣告啊 2012-04-22 00:09:34
jiaoyixiong(金幣+3): 感謝指導(dǎo)新手 2012-03-01 08:37:02
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| 建議你去找一本名字叫《蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測實(shí)驗(yàn)指南》化工出版社岳俊杰編的書，上面有比較簡單的操作方法，此外你再去分子模擬論壇上找一些相關(guān)實(shí)驗(yàn)資料基本就能上手了。 |
6樓2012-03-01 07:36:09
320080920001
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