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dw5601新蟲 (小有名氣)
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[求助]
請問如何進行蛋白突變體不同溫度下穩(wěn)定性的分子模擬
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| 小蟲最近在做定點突變提高酶的熱穩(wěn)定性實驗。我先通過蛋白序列比對找了兩個突變位點,進行了突變,發(fā)現(xiàn)突變后蛋白半衰期(熱穩(wěn)定性)提高了2倍,結果還行。所以想整理一下資料看看能不能發(fā)個文章。但是,我發(fā)現(xiàn),國外好多文章都是先用DS等軟件進行分析,找到不穩(wěn)定區(qū)域,然后再找突變位點,并且進行MD模擬,計算不同溫度下的突變體及原來蛋白RMSD,甚至還計算單個殘基的RMSD。這樣寫好像檔次提升了很多。我也想做點這方面的東西,但是不知從何入手。用什么軟件,怎樣操作?請問哪位站友能給小弟指點一下。 |
新蟲 (小有名氣)
金蟲 (小有名氣)
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