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wendy76銀蟲 (小有名氣)
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[交流]
這樣的序列比對結(jié)果在基因組中的拷貝數(shù)是1個還是2個？
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Sample Text這樣的比對結(jié)果表明，序列在基因組中的拷貝數(shù)，是1個還是2個？都在2號染色體，怎么判斷是1個拷貝還是2個拷貝？這兩個參考序列難道是同一條序列？ 為什么在參考序列1（ref|NT_005403.17）中，該序列在18703 bp at 5' side Hox-D8 ，1222 bp at 3' side:Hox-D4 而在參考序列2（ref|NW_001838863.1）中，該序列在18699 bp at 5' sideHox-D8 ，1222 bp at 3' side:Hox-D4 blast hits 有2條：顯示如下： 兩條序列都100%比對上， （1）>ref|NT_005403.17|  Homo sapiens chromosome 2 genomic contig, GRCh37.p5 Primary AssemblyLength=84213159Features flanking this part of subject sequence: 18703 bp at 5' side: homeobox protein Hox-D8 isoform 31222 bp at 3' side: homeobox protein Hox-D4 Score = 182 bits (98), Expect = 6e-44 Identities = 98/98 (100%), Gaps = 0/98 (0%) Strand=Plus/Plus （2）>ref|NW_001838863.1| Homo sapiens chromosome 2 genomic contig, alternate assembly HuRef SCAF_1103279188396, whole genome shotgun sequenceLength=44081246 Features flanking this part of subject sequence: 18699 bp at 5' side: homeobox protein Hox-D8 isoform 31222 bp at 3' side: homeobox protein Hox-D4 Score = 182 bits (98), Expect = 6e-44 Identities = 98/98 (100%), Gaps = 0/98 (0%) Strand=Plus/Plus |
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