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小石頭2007金蟲 (正式寫手)
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[交流]
有做過熒光定量PCR的嗎? 已有7人參與
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我要準(zhǔn)備做熒光定量PCR,目的基因長(zhǎng)度136bp,用普通PCR擴(kuò)增,目的條帶單一,沒有非特異性擴(kuò)增,但是引物二聚體比較多。這樣的引物用來做熒光定量效果會(huì)好嗎? 再有,提取的RNA質(zhì)量對(duì)于后期熒光定量PCR有影響嗎?我提的RNA的OD260/280比值在1.8-2.0之間,但是OD260/230的比值一直偏小,大概在1左右。這樣的RNA能用來反轉(zhuǎn)錄,并作熒光定量PCR嗎? [ Last edited by 小石頭2007 on 2012-8-23 at 20:44 ] |
木蟲 (正式寫手)
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鐵桿木蟲 (職業(yè)作家)
| 引物很重要,引物二聚體對(duì)結(jié)果影響很大,做出的CT值數(shù)根本不準(zhǔn)。多設(shè)計(jì)幾對(duì)引物選一對(duì)最好的做。RNA的質(zhì)量還是很重要的。經(jīng)過DNase處理后A260/280~2。如果DNA處理不干凈是不行的,做反轉(zhuǎn)錄的時(shí)候要做負(fù)對(duì)照。A260/230最好在2,就我的經(jīng)驗(yàn)來看,稍微低一點(diǎn)問題不是很大。 |
木蟲 (職業(yè)作家)
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