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412667449新蟲 (正式寫手)
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[求助]
LPL基因序列里面有很多終止密碼子，怎么回事？
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| 最近克隆了一種魚類的LPL基因，并對其的序列進(jìn)行了測定，其長度約為1500bp。但是利用Blast里面的Translate程序進(jìn)行翻譯時(shí)，里面有將近15個(gè)終止密碼子。至怎么回事��？不是開放閱讀框不能被終止密碼子打斷嗎？為什么別人做出來的魚LPL基因怎么翻譯出來都是很連續(xù)的？跪求高人指點(diǎn)。 |
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robert-RBT
木蟲 (小有名氣)
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【答案】應(yīng)助回帖
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412667449: 金幣+20, ★★★很有幫助, 回答的很專業(yè)啊，謝謝，我是這方面的額菜鳥，根據(jù)您的建議我再進(jìn)一步看一看，萬分感謝啊 2012-07-31 09:10:41
412667449: 金幣+20, ★★★很有幫助, 回答的很專業(yè)啊，謝謝，我是這方面的額菜鳥，根據(jù)您的建議我再進(jìn)一步看一看，萬分感謝啊 2012-07-31 09:10:41
| 有2種可能�？赡苡袃�(nèi)含子。你可以通過race得到cDNA后，剔除內(nèi)含子后分析。也可以利用軟件分析預(yù)測內(nèi)含子，如http://augustus.gobics.de/。也有可能測序或克隆出現(xiàn)移碼或錯(cuò)配的情況。這種情況可以通過高保真酶擴(kuò)增序列來避免。如Phusion high-fidelity DNA polymerase. |
2樓2012-07-30 21:47:04
jiangpeace
鐵蟲 (小有名氣)
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3樓2012-08-18 15:04:52
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