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wygcsu木蟲 (小有名氣)
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[交流]
系統(tǒng)發(fā)育樹bootsrap 已有5人參與
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為什么在構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹時，一些節(jié)點沒有bootsrap值，不知道什么意思，是可靠還是不可靠？bootsrap值究竟代表什么意思？是怎么得來的？為什么有的是幾百，有的樹卻是幾十？求大俠們解釋 [ Last edited by wygcsu on 2012-8-6 at 09:38 ] |
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lymkitty
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Bootstrap（進化樹） 即自展值，是用來檢驗?zāi)闼嬎愕倪M化樹分支可信度的。簡單地講就是把序列的位點都重排，重排后的序列再用相同的辦法構(gòu)樹，如果原來樹的分枝在重排后構(gòu)的樹中也出現(xiàn)了，就給這個分枝打上一分，如果沒出現(xiàn)就給0分，這樣經(jīng)過你給定的repetitions次（至少1000次）重排構(gòu)樹打分后，每個分枝就都得出分值，計算機會給你換算成bootstrap值。重排的序列有很多組合，值越小說明分枝的可信度越低，最好根據(jù)數(shù)據(jù)的情況選用不同的構(gòu)樹方法和模型. |
9樓2014-07-03 09:29:01
yananhl
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ghs25372216
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5樓2012-08-06 11:15:55
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