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請(qǐng)教PCR高手,使用SYBR Green I法進(jìn)行熒光定量PCR對(duì)于產(chǎn)物大小有什么要求? 已有3人參與
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| 本人打算做熒光定量PCR,現(xiàn)在做了普通的rt-pcr,三種基因的大小為352bp,362bp,228bp,結(jié)果都擴(kuò)增出來了,下一步打算做熒光定量RT-PCR,熒光染料為SYBR,請(qǐng)問是不是可以接著使用普通Rt-PCR中所使用的引物呢,還是重新設(shè)計(jì)引物,使其產(chǎn)物大小在50-150bp之間???求解答?? |
銅蟲 (小有名氣)
新蟲 (小有名氣)

木蟲 (職業(yè)作家)
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228可以試試。 我做過80-400bp的,200多點(diǎn)有的引物還是可以的,但是片段太長(zhǎng)PCR效率就有點(diǎn)低,并且有非特異PEAK, 我一般用60度退火,但是提高溫度到65度,可以減少或者消除非特異PEAK. 具體條件不能完全根據(jù)報(bào)道,具體情況具體分析,不過個(gè)人覺得,100-200左右的就很好。如果你的228效果不好,可以試試重新設(shè)計(jì)引物把目標(biāo)片段定于150bp左右。 |
木蟲 (職業(yè)作家)
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