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小木蟲論壇-學術(shù)科研互動平臺 » 計算模擬區(qū) » 分子模擬 » 其他 » 分子模擬到底有多深奧呀？
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歐陽平平木蟲 (正式寫手)
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[求助]
分子模擬到底有多深奧呀？
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剛進實驗室不久，第一次聽到分子模擬這個詞的時候就覺得太高深了，懷著敬而遠之的態(tài)度。但是貌似今后要經(jīng)常和它打交道，所以下定決心好好學習�？墒强戳艘槐娟P(guān)于分子模擬的書，才到一半就讀不下去了，好難理解啊... 不知道大家當時都是怎么學習并掌握分子模擬的？有什么好的建議嗎？還有大家的課題是怎么定的呢？是導師直接安排還是自己尋覓的？如果有此領(lǐng)域的博士師兄師姐的話，能給小女子點建議嗎，關(guān)于課題方面的，因為我可能也要成為你們中的一員了。感激不盡呀~~~ |
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2樓2012-08-21 16:43:17
chaizhm
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【答案】應助回帖
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感謝參與，應助指數(shù) +1
歐陽平平: 金幣+6, ★★★★★最佳答案, 謝謝你呢~嘻嘻，以后還請多多指教 2012-08-21 21:17:22
jiaoyixiong: 金幣+5, 贊chaizhm 版主的細致講解 2012-09-16 20:46:32
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jiaoyixiong: 金幣+5, 贊chaizhm 版主的細致講解 2012-09-16 20:46:32
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我感覺大面上對分子模擬理論了解一下還是很有必要的，因為分子模擬基礎理論是建立在經(jīng)典牛頓定律上的，不應該很麻煩 入門的話可以看看本版置頂帖里面推薦的一些書籍，先看中文再看英文，不管能不能看懂，先耐心看一遍，大體知道講什么，然后再認真看 一般入門得一段時間，但是一旦入門了就比較快了。了解基本理論以后就可以考慮是自己編程序，還是找現(xiàn)成的軟件做計算 我可以推薦兩本書，見附件 |
3樓2012-08-21 19:09:54
chaizhm
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4樓2012-08-21 19:12:37
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5樓2012-08-21 19:13:40
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6樓2012-09-16 20:11:32
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【答案】應助回帖
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chaizhm: 金幣+2, 謝謝~ 2012-09-18 09:07:16
chaizhm: 金幣+2, 謝謝~ 2012-09-18 09:07:16
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其實沒多深奧 所謂分子模擬，或者全程的分子動力學模擬，就是把一個個粒子（分子，原子，protein，cluster，etc）放在模擬盒子里，這些粒子根據(jù)牛頓定律運動，粒子之間有一些相互作用制約運動的軌跡和方向。在經(jīng)典分子模擬里，通常用力場等相互作用，在從頭計算里，用波函數(shù)方程計算原子間相互作用。 有了相互作用，根據(jù)牛頓定律運動，這些粒子跑啊跑啊就跑到了最后的結(jié)構(gòu)，就可以分析數(shù)據(jù)，整理數(shù)據(jù)，寫paper了 |
7樓2012-09-17 22:23:37
meixinqing
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8樓2012-09-17 22:26:19
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