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歐陽(yáng)平平木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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[求助]
分子模擬到底有多深?yuàn)W呀?
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剛進(jìn)實(shí)驗(yàn)室不久,第一次聽(tīng)到分子模擬這個(gè)詞的時(shí)候就覺(jué)得太高深了,懷著敬而遠(yuǎn)之的態(tài)度。但是貌似今后要經(jīng)常和它打交道,所以下定決心好好學(xué)習(xí)?墒强戳艘槐娟P(guān)于分子模擬的書(shū),才到一半就讀不下去了,好難理解啊... 不知道大家當(dāng)時(shí)都是怎么學(xué)習(xí)并掌握分子模擬的?有什么好的建議嗎?還有大家的課題是怎么定的呢?是導(dǎo)師直接安排還是自己尋覓的?如果有此領(lǐng)域的博士師兄師姐的話,能給小女子點(diǎn)建議嗎,關(guān)于課題方面的,因?yàn)槲铱赡芤惨蔀槟銈冎械囊粏T了。感激不盡呀~~~ |

| 你是博士準(zhǔn)備做分子模擬的?分子模擬也有很多種啊,就是不同領(lǐng)域的也有不少差異,感覺(jué)應(yīng)該具體點(diǎn)看,不能從大方面看分子模擬啊。具體看你想要模擬哪些方面,在找相應(yīng)軟件學(xué)習(xí) |
木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
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我感覺(jué)大面上對(duì)分子模擬理論了解一下還是很有必要的,因?yàn)榉肿幽M基礎(chǔ)理論是建立在經(jīng)典牛頓定律上的,不應(yīng)該很麻煩 入門(mén)的話可以看看本版置頂帖里面推薦的一些書(shū)籍,先看中文再看英文,不管能不能看懂,先耐心看一遍,大體知道講什么,然后再認(rèn)真看 一般入門(mén)得一段時(shí)間,但是一旦入門(mén)了就比較快了。了解基本理論以后就可以考慮是自己編程序,還是找現(xiàn)成的軟件做計(jì)算 我可以推薦兩本書(shū),見(jiàn)附件 |

木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)

木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)

金蟲(chóng) (小有名氣)
金蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
梅心晴|一只蘑菇
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其實(shí)沒(méi)多深?yuàn)W 所謂分子模擬,或者全程的分子動(dòng)力學(xué)模擬,就是把一個(gè)個(gè)粒子(分子,原子,protein,cluster,etc)放在模擬盒子里,這些粒子根據(jù)牛頓定律運(yùn)動(dòng),粒子之間有一些相互作用制約運(yùn)動(dòng)的軌跡和方向。在經(jīng)典分子模擬里,通常用力場(chǎng)等相互作用,在從頭計(jì)算里,用波函數(shù)方程計(jì)算原子間相互作用。 有了相互作用,根據(jù)牛頓定律運(yùn)動(dòng),這些粒子跑啊跑啊就跑到了最后的結(jié)構(gòu),就可以分析數(shù)據(jù),整理數(shù)據(jù),寫(xiě)paper了 |

金蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
梅心晴|一只蘑菇

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