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歐陽(yáng)平平木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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[求助]
分子模擬到底有多深?yuàn)W呀？
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剛進(jìn)實(shí)驗(yàn)室不久，第一次聽(tīng)到分子模擬這個(gè)詞的時(shí)候就覺(jué)得太高深了，懷著敬而遠(yuǎn)之的態(tài)度。但是貌似今后要經(jīng)常和它打交道，所以下定決心好好學(xué)習(xí)。可是看了一本關(guān)于分子模擬的書(shū)，才到一半就讀不下去了，好難理解啊... 不知道大家當(dāng)時(shí)都是怎么學(xué)習(xí)并掌握分子模擬的？有什么好的建議嗎？還有大家的課題是怎么定的呢？是導(dǎo)師直接安排還是自己尋覓的？如果有此領(lǐng)域的博士師兄師姐的話(huà)，能給小女子點(diǎn)建議嗎，關(guān)于課題方面的，因?yàn)槲铱赡芤惨蔀槟銈冎械囊粏T了。感激不盡呀~~~ |
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★
chaizhm: 金幣+2, 謝謝~ 2012-09-18 09:07:16
chaizhm: 金幣+2, 謝謝~ 2012-09-18 09:07:16
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其實(shí)沒(méi)多深?yuàn)W 所謂分子模擬，或者全程的分子動(dòng)力學(xué)模擬，就是把一個(gè)個(gè)粒子（分子，原子，protein，cluster，etc）放在模擬盒子里，這些粒子根據(jù)牛頓定律運(yùn)動(dòng)，粒子之間有一些相互作用制約運(yùn)動(dòng)的軌跡和方向。在經(jīng)典分子模擬里，通常用力場(chǎng)等相互作用，在從頭計(jì)算里，用波函數(shù)方程計(jì)算原子間相互作用。 有了相互作用，根據(jù)牛頓定律運(yùn)動(dòng)，這些粒子跑啊跑啊就跑到了最后的結(jié)構(gòu)，就可以分析數(shù)據(jù)，整理數(shù)據(jù)，寫(xiě)paper了 |
7樓2012-09-17 22:23:37
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
chaizhm: 金幣+1, 謝謝交流~ 2012-08-21 19:06:19
歐陽(yáng)平平: 金幣+3, ★★★很有幫助, 就是分不清那么多種都能做什么，迷茫著呢，呵呵。不過(guò)謝謝你呀~ 2012-08-21 21:18:18
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
chaizhm: 金幣+1, 謝謝交流~ 2012-08-21 19:06:19
歐陽(yáng)平平: 金幣+3, ★★★很有幫助, 就是分不清那么多種都能做什么，迷茫著呢，呵呵。不過(guò)謝謝你呀~ 2012-08-21 21:18:18
| 你是博士準(zhǔn)備做分子模擬的？分子模擬也有很多種啊，就是不同領(lǐng)域的也有不少差異，感覺(jué)應(yīng)該具體點(diǎn)看，不能從大方面看分子模擬啊。具體看你想要模擬哪些方面，在找相應(yīng)軟件學(xué)習(xí) |
2樓2012-08-21 16:43:17
chaizhm
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
歐陽(yáng)平平: 金幣+6, ★★★★★最佳答案, 謝謝你呢~嘻嘻，以后還請(qǐng)多多指教 2012-08-21 21:17:22
jiaoyixiong: 金幣+5, 贊chaizhm 版主的細(xì)致講解 2012-09-16 20:46:32
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
歐陽(yáng)平平: 金幣+6, ★★★★★最佳答案, 謝謝你呢~嘻嘻，以后還請(qǐng)多多指教 2012-08-21 21:17:22
jiaoyixiong: 金幣+5, 贊chaizhm 版主的細(xì)致講解 2012-09-16 20:46:32
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我感覺(jué)大面上對(duì)分子模擬理論了解一下還是很有必要的，因?yàn)榉肿幽M基礎(chǔ)理論是建立在經(jīng)典牛頓定律上的，不應(yīng)該很麻煩 入門(mén)的話(huà)可以看看本版置頂帖里面推薦的一些書(shū)籍，先看中文再看英文，不管能不能看懂，先耐心看一遍，大體知道講什么，然后再認(rèn)真看 一般入門(mén)得一段時(shí)間，但是一旦入門(mén)了就比較快了。了解基本理論以后就可以考慮是自己編程序，還是找現(xiàn)成的軟件做計(jì)算 我可以推薦兩本書(shū)，見(jiàn)附件 |
3樓2012-08-21 19:09:54
chaizhm
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4樓2012-08-21 19:12:37
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