| 9 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1213 | 回復(fù): 8 | ||
daniell251木蟲 (著名寫手)
|
[求助]
如何做Kohn-Sham orbital energy diagram
|
|
請問各位如何能做出如下的圖 用Gaussian得到MO的數(shù)據(jù)后需要自己分析嗎 還是有專門的軟件來完成這個(gè)任務(wù)?另外圖中 24%Au 之類的代表什么呢 從哪里得來的 圖出自Angew. Chem. Int. Ed 2012, 51, 5924 謝謝大家了 |
至尊木蟲 (著名寫手)
本人已永久離開小木蟲
|
24%表明整體分子的LUMO軌道有24%是由Me3PAu片段的分子軌道構(gòu)成的。 可以用收費(fèi)的AOMix結(jié)合Origin做這種圖。 不過,使用其它免費(fèi)的電荷轉(zhuǎn)移分解(CDA)程序,稍加修改,應(yīng)該也能得到整體分子軌道中片段分子軌道的成份。這樣,根據(jù)能量高低,把整體分子軌道畫在中間位置(畫條短橫線),把Me3PAu片段的分子軌道畫在左邊,吲哚的畫在右邊。若整體分子軌道中片段分子軌道的成份大于一定閾值,就把相應(yīng)的橫線連上。之后再自行標(biāo)上文字之類,就得到這樣的圖了 |
至尊木蟲 (著名寫手)
本人已永久離開小木蟲
|
整體分子軌道對應(yīng)的圖中的橫杠,只與對它貢獻(xiàn)較大(高于閾值)的片段分子軌道對應(yīng)的橫杠畫上連線(有時(shí)在連線上直接標(biāo)出貢獻(xiàn)值)。以便于從圖上直接看出整體分子軌道是主要由哪些片段分子軌道所貢獻(xiàn)的。 由于對整體分子軌道貢獻(xiàn)較高的片段分子軌道的數(shù)目較少,因此如果閾值設(shè)得高,連線數(shù)目就會較少。如果閾值低,連線數(shù)目自然就會多。如果閾值設(shè)成0,那么無論片段分子軌道對整體分子軌道有多少貢獻(xiàn),都會被連上,這樣的話圖上就會有一大堆連線,非;靵y,根本都看不清主次了。 至于你問Multiwfn能不能做,目前2.5版還不支持,預(yù)計(jì)會在2.7版支持CDA功能并能直接做這種圖。 |
木蟲 (著名寫手)
至尊木蟲 (著名寫手)
本人已永久離開小木蟲
木蟲 (著名寫手)
至尊木蟲 (著名寫手)
本人已永久離開小木蟲
木蟲 (著名寫手)
|
我從論壇里下了一個(gè)AOMix 自己算了一下手冊上的例子 BH3CO 在AOMix-FO運(yùn)行后的輸出文件AOMix-MO-FO-alpha.txt中有一些百分?jǐn)?shù)類似于 LUMO+0[#12, 3.161 eV]= Fr 1: 7.2%L+1 3.0%H-0 1.8%L+2 Fr 2: 48.6%L+0 S(-0.319 0.242 0.085 ) OP(0.08 -0.10 -0.01 ) 38.0%L+1 S(0.085 -0.061 0.319 ) OP(0.02 -0.02 0.03 ) 這是不是指 在BH3CO的LUMO上 片段1貢獻(xiàn)了7.2+3.0+1.8=12% 然后片段2貢獻(xiàn)了48.6+38=86.6% 是這么理解吧?謝謝啦 |
至尊木蟲 (著名寫手)
本人已永久離開小木蟲
| 9 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 329求調(diào)劑 +8 | 想上學(xué)吖吖 2026-03-19 | 8/400 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研]
|
然11 2026-03-19 | 3/150 |
|
|
[考研] 296求調(diào)劑 +5 | www_q 2026-03-18 | 9/450 |
|
|
[考研] 0817 化學(xué)工程 299分求調(diào)劑 有科研經(jīng)歷 有二區(qū)文章 +22 | rare12345 2026-03-18 | 22/1100 |
|
|
[考研] 材料學(xué)求調(diào)劑 +4 | Stella_Yao 2026-03-20 | 4/200 |
|
|
[考研] 一志愿西安交通大學(xué) 學(xué)碩 354求調(diào)劑 +3 | 我想要讀研究生 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +3 | @taotao 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +3 | eation27 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
[考研] 08工學(xué)調(diào)劑 +5 | 用戶573181 2026-03-20 | 5/250 |
|
|
[考研] 一志愿蘇州大學(xué)材料求調(diào)劑,總分315(英一) +3 | sbdksD 2026-03-19 | 3/150 |
|
|
[考研] 294求調(diào)劑材料與化工專碩 +14 | 陌の森林 2026-03-18 | 14/700 |
|
|
[考博] 申博26年 +3 | 八6八68 2026-03-19 | 3/150 |
|
|
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑 +4 | 18889395102 2026-03-18 | 4/200 |
|
|
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑 +5 | pupcoco 2026-03-17 | 8/400 |
|
|
[考研] 08工科 320總分 求調(diào)劑 +5 | 梨花珞晚風(fēng) 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
[考研] 299求調(diào)劑 +5 | △小透明* 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
[考研] 326求調(diào)劑 +5 | 上岸的小葡 2026-03-15 | 6/300 |
|
|
[考研] 304求調(diào)劑 +5 | 素年祭語 2026-03-15 | 5/250 |
|
|
[考研] 070303 總分349求調(diào)劑 +3 | LJY9966 2026-03-15 | 5/250 |
|
|
[考研] 中科大材料與化工319求調(diào)劑 +3 | 孟鑫材料 2026-03-14 | 3/150 |
|