 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 3 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1232 | 回復(fù): 2 | ||
[求助]
MPI并行出錯，誠心求助~~
|
|
為了問題描述，我從最開始來： 1. 程序編譯mpif77 test.f 得到a.out編譯文件 2. 腳本：#!/bin/bash #PBS -l nodes=2:ppn=4 #PBS -l walltime=640:01:00 cd $PBS_O_WORKDIR mpirun ./a.out 最簡單的腳本，要求不高，只要能運(yùn)行。 3. 我程序中寫明要輸出8個文件，結(jié)果只有進(jìn)程0輸出文件。 4. 結(jié)果：job_mpitest.e2059這個文件顯示： /etc/profile.d/msi.sh: line 8: /home/msi/Accelrys/LicensePack/etc/lp_profile: Permission denied /etc/profile.d/msi.sh: line 9: /home/msi/Accelrys/MaterialsStudio44/share/license/data/lic_setup.sh: Permission denied MPI Application rank 0 exited before MPI_Init() with status 0 5. 這個程序在別的集群上計(jì)算完全可行的，沒問題。可以排除程序問題。 問題： Q1：這個報(bào)錯是什么意思？搞不明白 Q2: 是不是這臺集群的MPI有問題？還是我哪里設(shè)置不對？ Q3：賬號下面的“.bashrc”文件內(nèi)容是： # .bashrc # User specific aliases and functions alias rm='rm -i' alias cp='cp -i' alias mv='mv -i' # Source global definitions if [ -f /etc/bashrc ]; then . /etc/bashrc fi export MPI_CC=icc export MPI_F77=ifort export MPI_F90=ifort export MPI_CXX=icpc MPI_ROOT=/opt/hpmpi PATH=${MPI_ROOT}/bin:$PATH MANPATH=${MPI_ROOT}/share/man:$MANPATH LD_LIBRARY_PATH=${MPI_ROOT}/lib/linux_amd64:$LD_LIBRARY_PATH export LM_LICENSE_FILE=${MPI_ROOT}/licenses/license.dat:$LM_LICENSE_FILE export PATH MANPATH LD_LIBRARY_PATH export MPI_REMSH=/usr/bin/ssh 知道的大蝦請幫忙啊~~大量金幣贈送~~ 另外：我拷貝http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=3389790這個帖子的源代碼，然后在我的機(jī)子上編譯可以，悲劇的是： [jiang1@node1 yang-2d]$ mpirun -np 4 ./matrix /etc/profile.d/msi.sh: line 8: /home/msi/Accelrys/LicensePack/etc/lp_profile: Permission denied /etc/profile.d/msi.sh: line 9: /home/msi/Accelrys/MaterialsStudio44/share/license/data/lic_setup.sh: Permission denied /etc/profile.d/msi.sh: line 8: /home/msi/Accelrys/LicensePack/etc/lp_profile: Permission denied /etc/profile.d/msi.sh: line 9: /home/msi/Accelrys/MaterialsStudio44/share/license/data/lic_setup.sh: Permission denied /etc/profile.d/msi.sh: line 8: /home/msi/Accelrys/LicensePack/etc/lp_profile: Permission denied /etc/profile.d/msi.sh: line 9: /home/msi/Accelrys/MaterialsStudio44/share/license/data/lic_setup.sh: Permission denied 同樣的問題��！求解 [ Last edited by yjhqdm on 2012-9-6 at 19:03 ] |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
0856，材料與化工321分求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
0703化學(xué)求調(diào)劑，各位老師看看我�。�！
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
266分，求材料冶金能源化工等調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
張芳銘-中國農(nóng)業(yè)大學(xué)-環(huán)境工程專碩-298
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
070300化學(xué)求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
086000調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
320分，材料與化工專業(yè)，求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
265求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
295材料工程專碩求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
高溫高壓反應(yīng)求助
已經(jīng)有4人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價值貼推薦，對您同樣有幫助:
- vasp 集群并行出錯
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 求助，編譯Nwchem 總一在一個地方出錯：DMatrix-mpi.F
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 菜鳥求助 VASP5.2并行安裝 出錯
已經(jīng)有7人回復(fù)
- VASP并行計(jì)算出錯
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 關(guān)于NAMD mpi并行問題
已經(jīng)有4人回復(fù)
- vasp跨節(jié)點(diǎn)運(yùn)行出錯，mpiexec_node-1 (handle_stdin_input 1089)
已經(jīng)有5人回復(fù)
- vasp并行測試時出錯。
已經(jīng)有7人回復(fù)
- cp2k并行編譯出錯
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 并行編譯vasp出錯，make: *** 沒有規(guī)則可以創(chuàng)建“vasp”需要的目標(biāo)“xml.o”。 停止
已經(jīng)有12人回復(fù)
- vasp 并行運(yùn)算出錯
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 關(guān)于MPI并行編程的基本問題
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 【求助】mpi不并行。。。
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 【求助】mkl+ifort+openmpi+siesta3.并行安裝出錯
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 【求助】MPI2-1.0.8安裝出錯求助
已經(jīng)有5人回復(fù)
hnuzhoulin
金蟲 (小有名氣)
- 1ST強(qiáng)帖: 1
- 應(yīng)助: 7 (幼兒園)
- 金幣: 1202.8
- 紅花: 6
- 帖子: 265
- 在線: 49小時
- 蟲號: 778409
- 注冊: 2009-05-24
- 性別: GG
- 專業(yè): 計(jì)算機(jī)應(yīng)用技術(shù)
2樓2012-12-25 12:27:45
hnuzhoulin
金蟲 (小有名氣)
- 1ST強(qiáng)帖: 1
- 應(yīng)助: 7 (幼兒園)
- 金幣: 1202.8
- 紅花: 6
- 帖子: 265
- 在線: 49小時
- 蟲號: 778409
- 注冊: 2009-05-24
- 性別: GG
- 專業(yè): 計(jì)算機(jī)應(yīng)用技術(shù)
3樓2012-12-25 13:27:28
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 yjhqdm 的主題更新
| 3 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 一志愿211院校 344分 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)生物學(xué)學(xué)碩，求調(diào)劑 +5 | 丶風(fēng)雪夜歸人丶 2026-03-26 | 8/400 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研]
 一志愿 西北大學(xué) 總分282 英語一62 求調(diào)劑
+7
|
18419759900 2026-03-25 | 8/400 |
|
|
[考研] 材料與化工085600，總分304，本科有兩篇sci參與，求調(diào)劑 +10 | 幸運(yùn)的醬醬 2026-03-22 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 299求調(diào)劑 +6 | 嗯嗯嗯嗯2 2026-03-27 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 315調(diào)劑 +4 | 0860求調(diào)劑 2026-03-26 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 359求調(diào)劑 +4 | 王了個楠 2026-03-25 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 材料調(diào)劑 +8 | 匹克i 2026-03-23 | 8/400 |
|
|
|
[碩博家園] 招收生物學(xué)/細(xì)胞生物學(xué)調(diào)劑 +3 | IceGuo 2026-03-26 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 一志愿華理，數(shù)一英一285求A區(qū)調(diào)劑 +8 | AZMK 2026-03-25 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 一志愿北化求調(diào)劑 +3 | Jsman 2026-03-22 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 321求調(diào)劑 +5 | 材料cailiao 2026-03-21 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 286求調(diào)劑 +13 | Faune 2026-03-21 | 13/650 |
|
|
|
[考研] 環(huán)境專碩324分求調(diào)劑推薦 +5 | 軒小寧—— 2026-03-26 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿哈工大，085400，320，求調(diào)劑 +4 | gdlf9999 2026-03-24 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 334分 一志愿武理-080500 材料求調(diào)劑 +4 | 李李不服輸 2026-03-25 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 292求調(diào)劑 +4 | 鵝鵝鵝額額額額?/a> 2026-03-24 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 335求調(diào)劑 +4 | yuyu宇 2026-03-23 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 284求調(diào)劑 +3 | yanzhixue111 2026-03-23 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 280分求調(diào)劑 一志愿085802 +4 | PUMPT 2026-03-22 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 考研調(diào)劑 +3 | 呼呼？~+123456 2026-03-21 | 3/150 |
|