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scusmf鐵蟲(chóng) (初入文壇)
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[求助]
沒(méi)有已知抑制劑的潛在靶點(diǎn)抑制劑篩選
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| 現(xiàn)在有一個(gè)潛在靶點(diǎn)，有文章報(bào)道這個(gè)蛋白和某些癌癥有關(guān)，蛋白的三維結(jié)構(gòu)已經(jīng)通過(guò)同源建模構(gòu)建出來(lái)�，F(xiàn)在想針對(duì)這個(gè)靶點(diǎn)設(shè)計(jì)一些抑制劑，最好是篩選一些實(shí)體庫(kù)，如果效果好可以直接購(gòu)買(mǎi)，現(xiàn)在請(qǐng)問(wèn)能有哪些計(jì)算機(jī)藥物設(shè)計(jì)的方法可以用來(lái)進(jìn)行篩選？具體應(yīng)該怎么做？新手，求各位大神幫幫忙！ |
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jawang
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【答案】應(yīng)助回帖
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| 如果你現(xiàn)在已經(jīng)有了三維結(jié)構(gòu)，而且比較確定作用位點(diǎn)的話，可以先使用對(duì)接進(jìn)行化合物庫(kù)的篩選，對(duì)接軟件有很多，比如dock,autodock，都是免費(fèi)的。另外可以給予受體結(jié)構(gòu)進(jìn)行藥效團(tuán)模型的構(gòu)建，然后進(jìn)行篩選。如果目前已經(jīng)有了很多這個(gè)靶點(diǎn)的抑制劑，可以考慮建立qsar模型。實(shí)體庫(kù)可以使用zinc數(shù)據(jù)庫(kù)，maybridge等可以買(mǎi)的到的數(shù)據(jù)庫(kù)。 |
2樓2012-09-12 18:47:54
scusmf
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4樓2012-09-13 23:20:04
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