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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 計算模擬區(qū) » 分子模擬 » 專家會診 » 沒有已知抑制劑的潛在靶點抑制劑篩選
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scusmf鐵蟲 (初入文壇)
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[求助]
沒有已知抑制劑的潛在靶點抑制劑篩選
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| 現(xiàn)在有一個潛在靶點，有文章報道這個蛋白和某些癌癥有關，蛋白的三維結(jié)構(gòu)已經(jīng)通過同源建模構(gòu)建出來�，F(xiàn)在想針對這個靶點設計一些抑制劑，最好是篩選一些實體庫，如果效果好可以直接購買，現(xiàn)在請問能有哪些計算機藥物設計的方法可以用來進行篩選？具體應該怎么做？新手，求各位大神幫幫忙！ |
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houxuben
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4樓2012-09-13 23:20:04
jawang
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【答案】應助回帖
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| 如果你現(xiàn)在已經(jīng)有了三維結(jié)構(gòu)，而且比較確定作用位點的話，可以先使用對接進行化合物庫的篩選，對接軟件有很多，比如dock,autodock，都是免費的。另外可以給予受體結(jié)構(gòu)進行藥效團模型的構(gòu)建，然后進行篩選。如果目前已經(jīng)有了很多這個靶點的抑制劑，可以考慮建立qsar模型。實體庫可以使用zinc數(shù)據(jù)庫，maybridge等可以買的到的數(shù)據(jù)庫。 |
2樓2012-09-12 18:47:54
jawang
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5樓2012-09-14 20:43:16
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