Prettyswan

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[求助] 表面吸附，計(jì)算路徑不同，對(duì)應(yīng)不同的結(jié)果

我計(jì)算了兩個(gè)不同大小的超胞體系，2×2和4×4，對(duì)于不同大小的體系，H2O吸附位置是相同的，鍵角什么的也都相同。
這是4×4的初始結(jié)構(gòu)

這是得到的2×2的結(jié)果，為了方便比較，我將它擴(kuò)展成4×4的了

直接優(yōu)化得到的4×4的結(jié)構(gòu)

這是將2×2的結(jié)果擴(kuò)展成4×4，然后去掉多余H2O再次優(yōu)化后得到的結(jié)構(gòu)

兩種途徑得到的吸附能當(dāng)然也不一樣（Eads=E(Cu)+E(H2O)-E(toten)）

引用回帖:

4-a E(toten)= -234.304710 Eads=0.055378 #這是直接計(jì)算的，在所計(jì)算的三種結(jié)構(gòu)中，吸附能最小
----------------
2to4-a E(toten)= -234.483210 Eads=0.233878 #這是從2×2擴(kuò)展之后優(yōu)化來(lái)的，此結(jié)果跟2×2的三種結(jié)構(gòu)的吸附能的趨勢(shì)相符，吸附能最大；

所有的馳豫計(jì)算使用的INCAR是一樣的

引用回帖:

System = Cu(100)-surface H2O
PREC = Normal
EDIFF = 1E-5
EDIFFG = 1E-3
GGA = 91
ISPIN = 1
ICHARG = 2
ISTART = 0
ENCUT = 420
SIGMA = 0.2
ISMEAR = 1
ISIF = 2
IBRION = 1
ADDGRID = .True.
NSW = 120

LORBIT = 11
LREAL = Auto
NCORE = 12
LPLANE = .TRUE.
LSCALU = .FALSE.
NSIM = 4
LWAVE = .FALSE.
LCHARG = .FALSE.

[ Last edited by Prettyswan on 2012-9-17 at 20:54 ]

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【求助】表面吸附計(jì)算已經(jīng)有9人回復(fù)

1樓 2012-09-17 20:39:00

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不理解樓主為什么要這么做，但是一個(gè)分子在表面的吸附構(gòu)型肯定會(huì)有很多種的，對(duì)應(yīng)的吸附能也不會(huì)相同。你可以在4X4表面改變構(gòu)型，看能不能得到較大的那個(gè)吸附能。

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2樓2012-09-17 21:08:58

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引用回帖:

2樓: Originally posted by 書(shū)萬(wàn)里 at 2012-09-17 21:08:58
不理解樓主為什么要這么做，但是一個(gè)分子在表面的吸附構(gòu)型肯定會(huì)有很多種的，對(duì)應(yīng)的吸附能也不會(huì)相同。你可以在4X4表面改變構(gòu)型，看能不能得到較大的那個(gè)吸附能。

我做了三個(gè)構(gòu)型，只不過(guò)這種構(gòu)型有點(diǎn)異常，所以單獨(dú)拿出來(lái)了。
在2×2的超胞中，應(yīng)該是正常的，但是4×4的超胞中，這種構(gòu)型優(yōu)化的結(jié)果跟2×2的超胞出入太大，所以用了上述方法重新計(jì)算了一下。

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3樓2012-09-18 08:55:44

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yourne

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請(qǐng)教樓主對(duì)于吸附率/吸附量的問(wèn)題是如何處理的？還是說(shuō)一個(gè)超晶胞只對(duì)應(yīng)了一個(gè)分子？我經(jīng)�？吹轿墨I(xiàn)中提到monolayer，但是一直不知道在計(jì)算中具體如何處理這個(gè)問(wèn)題。
另外，正常情況下，在幾何優(yōu)化后最外層原子是一定有弛豫的吧？

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“自由有許多困難，民主亦非完美，然而我們從未建造一堵墻把我們的人民關(guān)在里面，不準(zhǔn)他們離開(kāi)我們�！� ——肯尼迪

4樓2012-09-18 10:34:54

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3樓: Originally posted by Prettyswan at 2012-09-18 08:55:44
我做了三個(gè)構(gòu)型，只不過(guò)這種構(gòu)型有點(diǎn)異常，所以單獨(dú)拿出來(lái)了。
在2×2的超胞中，應(yīng)該是正常的，但是4×4的超胞中，這種構(gòu)型優(yōu)化的結(jié)果跟2×2的超胞出入太大，所以用了上述方法重新計(jì)算了一下。...

我說(shuō)漏了一點(diǎn)，超胞過(guò)小的話，吸附分子之間的相互作用可能會(huì)影響吸附能。樓主可以不斷增大超胞，看吸附能能不能趨于一致（這時(shí)候分子間作用就應(yīng)該很小了）。

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5樓2012-09-18 10:40:51

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hakuna

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H2O在金屬表面上的吸附研究很多了，2003年P(guān)RL上專門討論了吸附模型，本人那是也干過(guò)這活兒。如果一個(gè)cell中只放一個(gè)水分子的話，吸附構(gòu)型不會(huì)有多少改變，除非你的初始構(gòu)型有問(wèn)題。

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6樓2012-09-19 06:23:47

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