 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 8 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1675 | 回復(fù): 7 | |||
落楓4161296鐵蟲 (小有名氣)
|
[求助]
氨基酸和混合溶劑形成的氫鍵問題
|
|
用高斯計(jì)算，是計(jì)算溶劑模型還是溶劑效應(yīng) 酪氨酸（還有色氨酸） 和水以及異丙醇的混合溶劑形成的氫鍵怎么算，我要看酪氨酸和混合溶劑形成的氫鍵。還有酪氨酸和單個溶劑形成的氫鍵又怎么算 萬分感謝，等待急用 |
回復(fù)此樓» 收錄本帖的淘帖專輯推薦
 氫鍵 |
» 猜你喜歡
高效微納米儲能材料與產(chǎn)業(yè)化推進(jìn)實(shí)驗(yàn)室 蘇州 招收碩士研究生（含調(diào)劑）
已經(jīng)有2人回復(fù)
-
研究生招生
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
物理化學(xué)論文潤色/翻譯怎么收費(fèi)?
已經(jīng)有74人回復(fù)
-
化學(xué)化工學(xué)院 招收化工、化學(xué)、材料等相關(guān)方向研究生（學(xué)碩、專碩都有調(diào)劑名額）
已經(jīng)有1人回復(fù)
-
高效微納米儲能材料與產(chǎn)業(yè)化推進(jìn)實(shí)驗(yàn)室 蘇州 招收碩士研究生（含調(diào)劑）
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
溫州大學(xué)新能源材料微觀溯源課題組招收2026級博士研究生（材料、化學(xué)方向）
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
材料與化工 323 英一+數(shù)二+物化，一志愿：哈工大 本人本科雙一流
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
26申博
已經(jīng)有2人回復(fù)
-
山西大學(xué)資源與環(huán)境工程研究所化工分離/環(huán)境功能材料小組招收2026年博士生
已經(jīng)有2人回復(fù)
-
巴黎西岱大學(xué)（Université Paris Cité）Fayna MAMMERI 導(dǎo)師尋找CSC公派博士生
已經(jīng)有9人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價值貼推薦，對您同樣有幫助:
- 關(guān)于溶劑中形成氫鍵的大小測量
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 形成氫鍵的化合物用什么溶劑養(yǎng)單晶可避免形成雙晶？
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 【討論】NMR表征氫鍵時溶劑的選擇？
已經(jīng)有24人回復(fù)
- 【分享】重結(jié)晶的一點(diǎn)技巧
已經(jīng)有33人回復(fù)
- 【求助】如何選擇手性分析柱
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 【分享】過柱子總結(jié)（吸附劑與洗脫劑）
已經(jīng)有224人回復(fù)
2樓2012-09-20 18:32:11
落楓4161296
鐵蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 2715.4
- 帖子: 53
- 在線: 149.1小時
- 蟲號: 1495403
- 注冊: 2011-11-16
- 性別: GG
- 專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
3樓2012-09-21 15:16:10
4樓2012-09-21 15:52:38
vigaryang
木蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 16 (小學(xué)生)
- 金幣: 3466.3
- 散金: 677
- 紅花: 6
- 帖子: 471
- 在線: 495.7小時
- 蟲號: 227097
- 注冊: 2006-03-23
- 性別: GG
- 專業(yè): 應(yīng)用化學(xué)
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
gmy1990: 金幣+3 2012-09-22 10:46:24
落楓4161296: 金幣+2, ★有幫助, 謝謝 2012-09-24 15:26:46
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
gmy1990: 金幣+3 2012-09-22 10:46:24
落楓4161296: 金幣+2, ★有幫助, 謝謝 2012-09-24 15:26:46
| 對于混合溶劑的氫鍵，如果用Gaussian算的話，如何構(gòu)建溶質(zhì)周圍的溶劑化層（即如何確定水分子和異丙醇分子的個數(shù)和位置）將是一大問題。對于這種情況，不如使用分子動力學(xué)模擬進(jìn)行計(jì)算，通過徑向分布函數(shù)可以獲得氫鍵作用的位點(diǎn)、個數(shù)、強(qiáng)度等信息。 |
5樓2012-09-21 23:04:14
落楓4161296
鐵蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 2715.4
- 帖子: 53
- 在線: 149.1小時
- 蟲號: 1495403
- 注冊: 2011-11-16
- 性別: GG
- 專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
6樓2012-09-24 14:02:56
sobereva
至尊木蟲 (著名寫手)
本人已永久離開小木蟲
- QC強(qiáng)帖: 17
- 應(yīng)助: 226 (大學(xué)生)
- 貴賓: 5.4
- 金幣: 2180.5
- 紅花: 217
- 帖子: 1241
- 在線: 366.8小時
- 蟲號: 281271
- 注冊: 2006-09-23
- 專業(yè): 宇宙學(xué)
【答案】應(yīng)助回帖
|
高斯可以做BOMD，無論是基于力場還是基于半經(jīng)驗(yàn)或是從頭算都能做。不過對你的問題來說使用不甚方便。用gromacs、tinker之類來跑比較適合，這幾個分子都有現(xiàn)成的合適的力場參數(shù)。之后從得到的動力學(xué)軌跡中截出一批幀，并且只保留酪氨酸，而鄰近的水和異丙醇只保留一個或數(shù)個。然后在隱式溶劑模型下經(jīng)過優(yōu)化后，可用來考察酪氨酸與水和異丙醇構(gòu)成的氫鍵。這實(shí)際上是雜化溶劑模型（臨近的溶劑顯式表達(dá)，而較遠(yuǎn)的作為平均場處理），在很多文獻(xiàn)中都有使用。 雖然直接根據(jù)動力學(xué)軌跡上做RDF也可以在一定程度上考察氫鍵，但沒法在量子力學(xué)級別上考察溶劑溶質(zhì)之間氫鍵的典型微觀結(jié)構(gòu)。 |
7樓2012-09-24 15:39:10
vigaryang
木蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 16 (小學(xué)生)
- 金幣: 3466.3
- 散金: 677
- 紅花: 6
- 帖子: 471
- 在線: 495.7小時
- 蟲號: 227097
- 注冊: 2006-03-23
- 性別: GG
- 專業(yè): 應(yīng)用化學(xué)
8樓2012-09-24 15:39:45
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 落楓4161296 的主題更新
| 8 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 307求調(diào)劑 +11 | 冷笙123 2026-03-17 | 11/550 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 生物學(xué)071000 329分求調(diào)劑 +5 | 我愛生物生物愛?/a> 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿 西北大學(xué) ，070300化學(xué)學(xué)碩，總分287，雙非一本，求調(diào)劑。 +3 | 晨昏線與星海 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 能源材料化學(xué)課題組招收碩士研究生8-10名 +5 | 脫穎而出 2026-03-16 | 17/850 |
|
|
|
[考研] 260求調(diào)劑 +3 | 朱芷琳 2026-03-20 | 4/200 |
|
|
|
[考研]
 一志愿東華大學(xué)化學(xué)070300，求調(diào)劑
+6
|
2117205181 2026-03-21 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 一志愿華中科技大學(xué)071000，求調(diào)劑 +4 | 沿岸有貝殼6 2026-03-21 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 材料學(xué)碩301分求調(diào)劑 +7 | Liyouyumairs 2026-03-21 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 266求調(diào)劑 +3 | 哇呼哼呼哼 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 279分求調(diào)劑 一志愿211 +14 | chaojifeixia 2026-03-19 | 15/750 |
|
|
|
[考研] 一志愿山大07化學(xué) 332分 四六級已過 本科山東雙非 求調(diào)劑！ +3 | 不想理你 2026-03-16 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 華東師范大學(xué)-071000生物學(xué)-293分-求調(diào)劑 +3 | 研究生何瑤明 2026-03-18 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿武漢理工材料工程專碩調(diào)劑 +9 | Doleres 2026-03-19 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑，一志愿:南京航空航天大學(xué)大學(xué) ，080500材料科學(xué)與工程學(xué)碩，總分289分 +4 | @taotao 2026-03-19 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 329求調(diào)劑 +9 | 想上學(xué)吖吖 2026-03-19 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 一志愿西安交通大學(xué) 學(xué)碩 354求調(diào)劑211或者雙一流 +3 | 我想要讀研究生 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 281求調(diào)劑（0805） +14 | 煙汐憶海 2026-03-16 | 25/1250 |
|
|
|
[考研] 085410人工智能專碩317求調(diào)劑（0854都可以） +4 | xbxudjdn 2026-03-18 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 081700化工學(xué)碩調(diào)劑 +3 | 【1】 2026-03-16 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 312求調(diào)劑 +8 | 陌宸希 2026-03-16 | 9/450 |
|