 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1676 | 回復: 7 | |||
| 當前只顯示滿足指定條件的回帖，點擊這里查看本話題的所有回帖 | |||
落楓4161296鐵蟲 (小有名氣)
|
[求助]
氨基酸和混合溶劑形成的氫鍵問題
|
||
|
用高斯計算，是計算溶劑模型還是溶劑效應 酪氨酸（還有色氨酸） 和水以及異丙醇的混合溶劑形成的氫鍵怎么算，我要看酪氨酸和混合溶劑形成的氫鍵。還有酪氨酸和單個溶劑形成的氫鍵又怎么算 萬分感謝，等待急用 |
回復此樓» 收錄本帖的淘帖專輯推薦
 氫鍵 |
» 猜你喜歡
求調(diào)劑，本科吉大，一志愿華工339
已經(jīng)有2人回復
-
意大利博洛尼亞大學招聘研究助理2名（2D材料/鋰離子與鈉離子電池方向）
已經(jīng)有1人回復
-
物理化學論文潤色/翻譯怎么收費?
已經(jīng)有173人回復
-
關(guān)于碳量子點抗菌的研究
已經(jīng)有15人回復
-
南大化學調(diào)劑
已經(jīng)有11人回復
-
0703調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復
-
1
已經(jīng)有21人回復
-
0703 調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復
-
西南某211招27屆博士
已經(jīng)有30人回復
-
大連工業(yè)杰青/長江團隊-生物質(zhì)材料-儲能電池方向招收2026級博士生
已經(jīng)有0人回復
» 本主題相關(guān)價值貼推薦，對您同樣有幫助:
- 關(guān)于溶劑中形成氫鍵的大小測量
已經(jīng)有3人回復
- 形成氫鍵的化合物用什么溶劑養(yǎng)單晶可避免形成雙晶？
已經(jīng)有6人回復
- 【討論】NMR表征氫鍵時溶劑的選擇？
已經(jīng)有24人回復
- 【分享】重結(jié)晶的一點技巧
已經(jīng)有33人回復
- 【求助】如何選擇手性分析柱
已經(jīng)有4人回復
- 【分享】過柱子總結(jié)（吸附劑與洗脫劑）
已經(jīng)有224人回復
sobereva
至尊木蟲 (著名寫手)
本人已永久離開小木蟲
- QC強帖: 17
- 應助: 226 (大學生)
- 貴賓: 5.4
- 金幣: 2180.5
- 紅花: 217
- 帖子: 1241
- 在線: 366.8小時
- 蟲號: 281271
- 注冊: 2006-09-23
- 專業(yè): 宇宙學
【答案】應助回帖
|
高斯可以做BOMD，無論是基于力場還是基于半經(jīng)驗或是從頭算都能做。不過對你的問題來說使用不甚方便。用gromacs、tinker之類來跑比較適合，這幾個分子都有現(xiàn)成的合適的力場參數(shù)。之后從得到的動力學軌跡中截出一批幀，并且只保留酪氨酸，而鄰近的水和異丙醇只保留一個或數(shù)個。然后在隱式溶劑模型下經(jīng)過優(yōu)化后，可用來考察酪氨酸與水和異丙醇構(gòu)成的氫鍵。這實際上是雜化溶劑模型（臨近的溶劑顯式表達，而較遠的作為平均場處理），在很多文獻中都有使用。 雖然直接根據(jù)動力學軌跡上做RDF也可以在一定程度上考察氫鍵，但沒法在量子力學級別上考察溶劑溶質(zhì)之間氫鍵的典型微觀結(jié)構(gòu)。 |
7樓2012-09-24 15:39:10
2樓2012-09-20 18:32:11
落楓4161296
鐵蟲 (小有名氣)
- 應助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 2715.4
- 帖子: 53
- 在線: 149.1小時
- 蟲號: 1495403
- 注冊: 2011-11-16
- 性別: GG
- 專業(yè): 理論和計算化學
3樓2012-09-21 15:16:10
4樓2012-09-21 15:52:38
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 263求調(diào)劑 +4 | yqdszhdap－ 2026-03-22 | 4/200 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 求調(diào)劑院校信息 +6 | CX 330 2026-03-21 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 291 求調(diào)劑 +3 | 化工2026屆畢業(yè)?/a> 2026-03-21 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿北京化工大學070300 學碩336求調(diào)劑 +5 | vv迷 2026-03-21 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 考研調(diào)劑 +4 | 來好運來來來 2026-03-21 | 4/200 |
|
|
|
[考研]
 一志愿070300浙大化學358分，求調(diào)劑！
+3
|
酥酥魚.. 2026-03-21 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 資源與環(huán)境 調(diào)劑申請(333分) +5 | holy J 2026-03-21 | 5/250 |
|
|
|
[考研]
 一志愿東華大學控制學碩320求調(diào)劑
+3
|
Grand777 2026-03-21 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 工科0856求調(diào)劑 +3 | 沐析汀汀 2026-03-21 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 307求調(diào)劑 +3 | 余意卿 2026-03-18 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +3 | .m.. 2026-03-21 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 0805材料320求調(diào)劑 +3 | 深海物語 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 279分求調(diào)劑 一志愿211 +14 | chaojifeixia 2026-03-19 | 15/750 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +3 | 白QF 2026-03-21 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 332求調(diào)劑 +3 | 鳳凰院丁真 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿天津大學化學工藝專業(yè)（081702）315分求調(diào)劑 +12 | yangfz 2026-03-17 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 二本跨考鄭大材料306英一數(shù)二 +3 | z1z2z3879 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 085601材料工程專碩求調(diào)劑 +10 | 慕寒mio 2026-03-16 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 0703化學調(diào)劑 +3 | 妮妮ninicgb 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 333求調(diào)劑 +3 | 文思客 2026-03-16 | 7/350 |
|