 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 2 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 744 | 回復(fù): 1 | |||
[交流]
文庫構(gòu)建質(zhì)控 已有1人參與
|
|
從信息分析角度，來檢測文庫構(gòu)建，或者樣品的好壞也是有一些方法的，這里只以轉(zhuǎn)錄組為例（BY seq.cn）： 1. 比回reference的比率。 如果原始樣品有其他物種樣品污染，則比回率會低于正常水平（~80%）。如果有污染，需要重新準(zhǔn)備樣品。 2. insert size大小分布 如果切膠正常，insert size和預(yù)期的分布應(yīng)該一致，如果不一致，則可能是切膠不均勻?qū)е�。如果insert size過短，會造成PE測序大部分都o(jì)verlap，雖然數(shù)據(jù)還可以繼續(xù)使用，但是造成很多浪費。 3. reads測序質(zhì)量分布 每個位點的質(zhì)量分布，這個是測序的影響。如果質(zhì)量過低，需要重測。 4. 用來計算表達(dá)量的reads總數(shù)。 對于mRNA測序，如果有小RNA的污染，則測序的很多reads是沒有對表達(dá)量有貢獻(xiàn)的，和其他樣品相比，這個數(shù)字會偏低，這也可以用來判斷是否有非mRNA的污染。 5. 其他質(zhì)控方法 大家補充啊。 |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
不合理蛙科研實驗之小鼠實驗：嚴(yán)謹(jǐn)設(shè)計，解析生命機制的重要載體
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實驗之重金屬檢測：精準(zhǔn)篩查，守護健康與環(huán)境的防線
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
化學(xué)工程及工業(yè)化學(xué)論文潤色/翻譯怎么收費?
已經(jīng)有228人回復(fù)
-
不合理蛙科研實驗之“蛙測重金屬我背鍋三千”
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實驗之“鼠逃三次我發(fā)三篇SCI”
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
納米粒度分析
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
林科院林化所招收材料與化工專業(yè)碩士，坐標(biāo)南京
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
留學(xué)--博士招生
已經(jīng)有16人回復(fù)
-
化學(xué)工程，本211，求調(diào)劑，ab區(qū)不限
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
邵陽學(xué)院食品與化學(xué)工程學(xué)院碩士調(diào)劑
已經(jīng)有0人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價值貼推薦，對您同樣有幫助:
- 基因組文庫構(gòu)建時DNA酶切片段用膠回收嗎？
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 【資料】宏基因組Fosmid 文庫構(gòu)建
已經(jīng)有84人回復(fù)
- 求助：基因組文庫構(gòu)建時一般用什么Marker？
已經(jīng)有12人回復(fù)
- 【求助/交流】構(gòu)建差減文庫起始用總RNA還是mRNA好
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 【求助/交流】誰用SMART的cDNA文庫構(gòu)建試劑盒？？？
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 【求助/交流】有構(gòu)建植物BAC文庫的同學(xué)？一起交流吧
已經(jīng)有17人回復(fù)
- 欲構(gòu)建擬南芥葉片cDNA文庫，請問用哪種方法提取總RNA的效果比較好？
已經(jīng)有7人回復(fù)
2樓2012-10-22 17:13:33
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 seq.cn 的主題更新
| 2 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 【求調(diào)劑】085601材料工程專碩 | 總分272 | +7 | 腳滑的守法公民 2026-03-27 | 7/350 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 一志愿北京化工大學(xué)材料與化工（085600）296求調(diào)劑 +17 | 稻妻小編 2026-03-26 | 17/850 |
|
|
|
[考研] 070305高分子化學(xué)與物理 304分求調(diào)劑 +12 | c297914 2026-03-28 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +4 | 青春裁為三截 2026-03-29 | 4/200 |
|
|
[考研] 070300化學(xué)354求調(diào)劑 +6 | 101次希望 2026-03-28 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 329求調(diào)劑 +7 | 星野? 2026-03-26 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 本科新能源科學(xué)與工程，一志愿華理能動285求調(diào)劑 +7 | AZMK 2026-03-28 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 食品工程專碩一志愿中海洋309求調(diào)劑 +4 | 小張zxy張 2026-03-26 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 材料與化工（0856）304求B區(qū)調(diào)劑 +8 | 邱gl 2026-03-27 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 283求調(diào)劑 +7 | A child 2026-03-28 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 315分求調(diào)劑 +7 | 26考研上岸版26 2026-03-26 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 295求調(diào)劑 +5 | 1428151015 2026-03-27 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 352分 化工與材料 +5 | 海納百川Ly 2026-03-27 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 275求調(diào)劑 +10 | jjjjjjjjjjl 2026-03-27 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 287求調(diào)劑 +10 | land xuxu 2026-03-26 | 10/500 |
|
|
|
[碩博家園] 北京林業(yè)大學(xué)碩導(dǎo)招生廣告 +6 | kongweilin 2026-03-26 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 打過很多競賽，085406控制工程300分，求調(diào)劑 +3 | askeladz 2026-03-26 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 材料專碩 335 分求調(diào)劑 +4 | 拒絕冷暴力 2026-03-25 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +3 | 李李不服輸 2026-03-25 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 材料調(diào)劑 +3 | iwinso 2026-03-23 | 3/150 |
|