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yqh1987銀蟲 (初入文壇)
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[求助]
菌種鑒定序列比對中遇到的問題
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| 想鑒定一株菌,做的16S rDNA部分序列測序,要建系統發(fā)育樹,去NCBI網站blast比對,在Database選項中要選擇others,但是他下面是個下拉框,里面有許多選項,不知道該選哪個?是nucleotide collection還是選最后一個的16S ribosomal RNA sequencces?? |
新蟲 (小有名氣)
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將你所需要比對的序列輸進去后,在Database選項中要選擇others,在他下面下拉框選nucleotide collection,點擊blast,(其他參數根據需要選擇)過一會兒即可出現比對結果。 具體可以看看這可帖子:熟練使用NCBI http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=3330923 |
銀蟲 (初入文壇)
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