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細菌16S rDNA焦磷酸測序會不會產(chǎn)生真核生物信息？ 已有1人參與
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| 我的實驗是用焦磷酸測序進行微生物分類鑒定。PCR擴增細菌16S rDNA V1-V3 region，8F (5'-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3') and 533R (5'-TTACCGCGGCTGCTGGCAC-3')。Silva106比對，Mothur分析（交給公司做的，技術員走人了）。最后的結果中，大部分序列屬于細菌，但有極少量序列被分配到幾個真核生物（節(jié)足動物門Arthropoda, 棘頭動物門Acanthocephala，毛顎動物門Chaetognatha, 軟體動物門Mollusca ）。這些門類中，Arthropoda有17條序，其他真核門類也就各1條序。真核生物的線粒體16s作為物種鑒定確實有這么個方法，但細菌16s和真核16s的引物應該不是通用的，照理來說不應該產(chǎn)生真核生物信息，不知怎么解釋？難道僅僅是errors in taxonomic assignment? 文章在大修，求教中，萬分感激！ |
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大山1928
銅蟲 (初入文壇)
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2樓2019-03-08 15:07:13
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