 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 3 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1012 | 回復(fù): 2 | ||
dson至尊木蟲 (著名寫手)
|
[求助]
計算0基礎(chǔ)菜鳥求助：優(yōu)化過渡態(tài)結(jié)構(gòu)并得到過渡態(tài)數(shù)據(jù)
|
|
各位大俠，小弟理論計算方面之前沒有接觸過，現(xiàn)在有如下三個底物：甲醇、己內(nèi)酯、二苯磷酸酯三個底物，可能存在的過渡態(tài)分別為TS1 TS2（對應(yīng)兩種不同的反應(yīng)機理，（第二張有氫鍵長度的圖是文獻中的截圖），現(xiàn)在我想知道算出第二幅圖中過渡態(tài)數(shù)據(jù)的方法。 文獻方法如下（看得云里霧里，想知道具體步驟）：Calculations were carried out with the Gaussian 03 suite of programs at the DFT level of theory using the hybrid functional B3PW91. Sulfur, nitrogen, carbon, oxygen and hydrogen atoms were described with a 6-31G(d,p) double-z basis set. Phosphorus and fluorine atoms were treated with a Stuttgart–Dresden pseudopotential in combination with its adapted basis set augmented by a set of polarization function d. Geometry optimizations were carried out without any symmetry restrictions, and the nature of the extrema was verified with analytical frequency calculations. The intrinsic reaction coordinate was followed using the IRC technique for all located transition states. The reference energy has been set to zero for the most stable ternary adduct of reactants. 第一個問題：通過看網(wǎng)上論壇以及文獻里的提示，在Gaussian計算前需要在chem3D中對結(jié)構(gòu)先進行優(yōu)化，那么請問是用哪個方法？MM2,還是mopac,或是其他在chem3D中的優(yōu)化結(jié)構(gòu)方法？ 第二個問題 chem3D中算出的氫鍵長度可不可靠（和文獻報道有較大差異）？Gaussian 09或者Gauss view中可以做氫鍵長度計算嗎？怎么搞捏？ 第三個問題 優(yōu)化好結(jié)構(gòu)后在Gaussian中用DFT作TS的計算（文獻有方法），如何從Gaussian計算后的那些一大片數(shù)據(jù)中找到有用的信息呢？ DPP CL MeOH 過渡態(tài).gif TS結(jié)構(gòu)及氫鍵.jpg [ 來自科研家族 高分子家族 ] |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
0702一志愿吉大B區(qū)求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
求調(diào)劑
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
物理學(xué)I論文潤色/翻譯怎么收費?
已經(jīng)有143人回復(fù)
-
0702一志愿吉大B區(qū)求調(diào)劑有論文
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
請問還有沒有用Latex寫文章的小伙伴們？
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
光學(xué)工程學(xué)碩調(diào)劑信息
已經(jīng)有32人回復(fù)
-
歡迎加入課題組
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
散金幣，求好運，祝面上順利！
已經(jīng)有76人回復(fù)
-
華東師范大學(xué)芯片設(shè)計徐瓏真實水平咋樣
已經(jīng)有1人回復(fù)
-
調(diào)劑
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
【新加坡】納米電子器件項目組有“聯(lián)合培養(yǎng)博士生”名額
已經(jīng)有0人回復(fù)
» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)
» 本主題相關(guān)價值貼推薦，對您同樣有幫助:
- 關(guān)于Dmol3優(yōu)化過渡態(tài)搜索問題
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 過渡態(tài)優(yōu)化出現(xiàn)兩個虛頻
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 過渡態(tài)優(yōu)化問題求助
已經(jīng)有13人回復(fù)
- 求助，l502錯誤怎么改？
已經(jīng)有11人回復(fù)
- gaussian09過渡態(tài)優(yōu)化出現(xiàn)l103錯誤，求解決
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 急求用高斯09怎么計算電子激發(fā)態(tài)
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 高斯能量單位轉(zhuǎn)換：優(yōu)化和過渡態(tài)中，所得能量的單位及單位轉(zhuǎn)換
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 溶劑效應(yīng)和優(yōu)化過渡態(tài)的問題
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 關(guān)于過渡態(tài)和能量優(yōu)化的問題
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 過渡態(tài)優(yōu)化，iop(1/8=1),能量曲線依然震蕩，我還要hold住嗎？
已經(jīng)有17人回復(fù)
- 【求助】opt=QST2輸入方法
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 【求助】在gaussian過渡態(tài)優(yōu)化計算出現(xiàn)的問題~請教高手~
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 【求助】高斯優(yōu)化過渡態(tài)出錯
已經(jīng)有14人回復(fù)
dson
至尊木蟲 (著名寫手)
- 應(yīng)助: 6 (幼兒園)
- 金幣: 12364.4
- 散金: 59
- 紅花: 4
- 帖子: 1352
- 在線: 296.2小時
- 蟲號: 699047
- 注冊: 2009-02-09
- 性別: GG
- 專業(yè): 藥物化學(xué)
這是為何...... 
2樓2012-10-20 13:21:10
 |
3樓2012-10-22 00:33:16
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 dson 的主題更新
| 3 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 北科281學(xué)碩材料求調(diào)劑 +8 | tcxiaoxx 2026-03-20 | 9/450 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 306求0703調(diào)劑一志愿華中師范 +6 | 紙魚ly 2026-03-21 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 0854電子信息求調(diào)劑 +3 | α____ 2026-03-22 | 3/150 |
|
|
[考研] 材料與化工085600，總分304，本科有兩篇sci參與，求調(diào)劑 +4 | 幸運的醬醬 2026-03-22 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 293求調(diào)劑 +12 | zjl的號 2026-03-16 | 17/850 |
|
|
|
[考研] 尋找調(diào)劑 +4 | 倔強芒? 2026-03-21 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 能源材料化學(xué)課題組招收碩士研究生8-10名 +5 | 脫穎而出 2026-03-16 | 17/850 |
|
|
|
[考研] 初試 317 +7 | 半拉月丙 2026-03-20 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 278求調(diào)劑 +9 | 煙火先于春 2026-03-17 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 268求調(diào)劑 +9 | 簡單點0 2026-03-17 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 303求調(diào)劑 +5 | 睿08 2026-03-17 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 化學(xué)求調(diào)劑 +4 | 臨澤境llllll 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 265求調(diào)劑 +9 | 梁梁校校 2026-03-17 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 296求調(diào)劑 +6 | www_q 2026-03-18 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 南京大學(xué)化學(xué)376求調(diào)劑 +3 | hisfailed 2026-03-19 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 一志愿南京理工大學(xué)085701資源與環(huán)境302分求調(diào)劑 +4 | 葵梓衛(wèi)隊 2026-03-18 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 288求調(diào)劑 +16 | 于海海海海 2026-03-19 | 16/800 |
|
|
|
[考研] 086500 325 求調(diào)劑 +3 | 領(lǐng)帶小熊 2026-03-19 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 288求調(diào)劑，一志愿華南理工大學(xué)071005 +5 | ioodiiij 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑 +5 | pupcoco 2026-03-17 | 8/400 |
|