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dongabcde銀蟲 (小有名氣)
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[求助]
關于Dmol3優(yōu)化過渡態(tài)搜索問題
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各位好，最近一直再用dmol 搜索過渡態(tài)，但是遇到好多的問題，我是算的有機小分子在金屬表面上氧化反應機理， 1，首先我用DMOL來優(yōu)化反應物在金屬表面的穩(wěn)定的吸附構型，但是老是計算出現(xiàn)錯誤，提示如下： Error: SCF iterations not converged in 50 iterations DELTE = -5.000000000000000E-003 Message: SCF not converging. Choose larger smearing value in DMol3 SCF panel or modify/delete "Occupation Thermal" in the input file. You may also need to change spin or use symmetry. Resubmit DMol3. Message: DMol3 job failed Error: DMol3 exiting 后來沒辦法只好用Castep 算出有機分子在pt（111）面上的結構優(yōu)化后的構型，結果發(fā)現(xiàn)構型基本上就沒大變化，但是也能算出來吸附能，不知道我這樣算是否合適，能不能保證是最穩(wěn)定的吸附位？ 2，然后我再將反應物和產物進行原子配對，配對之后用DMOL 來搜索過渡態(tài)，結果一直出現(xiàn)不收斂，一直出下面提示； Message: DMol3 job failed Error: DMol3 exiting Error: SCF iterations not converged in 100 iterations 我改變那個迭代次數(shù)改到了400還是出現(xiàn)上面的提示，一直是不收斂的。我把我建立的模型都在附件里面呈現(xiàn)了，請問各位大俠，能不能給在下提一些意見，被這些問題困惑了好長時間了，在線等熱心人幫助。我們這邊沒有用DMOL計算的，老師也不是搞這個的。全是靠一個人在小木蟲上尋求幫助。期待好心人。。 |
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2014-07-21 21:29:13, 537 K
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你的問題不僅僅只是調大迭代步數(shù)，重點在于前面的問題，否則算出來的結果都是錯的。 你確定文獻上的一定是對的？一般希望smearing盡可能小，而不是盡量希望大，使得輸出文件的kTeS項忽略不計，一般這個忽略不計按照VASP程序手冊認為是0.1meV/atom的大小。能量計算在使用了smearing也應該取外推到0K的binding energy。 電子自洽收斂困難的解決方式很多，smearing可以解決，但是其初衷并不是為了這個，并且會影響到能量的計算。 一般難收斂的情況可以調整charge mix和DIIS，使得計算的收斂趨勢和收斂速度達到平衡。通常調整這兩項就足以解決大部分問題。其他的只能是特殊情況特殊處理。 老師不做指導，讓學生做，對這種情況特別反感。尤其是碩士生，未必有那么好的判斷力。對這種情況超頭疼。 |
8樓2014-07-22 12:41:14
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