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有誰做過鏈霉菌抗生素基因簇里面的調(diào)控基因的,怎么研究啊,新手不大懂~~~
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我這個調(diào)控基因是SARP調(diào)控基因,想根圍繞這個基因做點東西,但是自己不知道怎么入手,能做哪些方面的工作啊?求高手指點。謝謝你們~~~~ |
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首先生物信息學(xué)分析,主要涉及調(diào)控蛋白及對應(yīng)結(jié)合部位的DNA 代謝調(diào)控的啟動子結(jié)構(gòu)分析 1)基因敲除, 突變子的篩選 2)調(diào)控蛋白的純化 3)EMSA(Electroforetic Mobility Shift Analyses)實驗鑒定調(diào)控蛋白的結(jié)合區(qū):將純化后的調(diào)控蛋白用不同的濃度與預(yù)測啟動子DNA進(jìn)行結(jié)合實驗, 觀察DNA的遷移率確定結(jié)合的區(qū)域。 4)對調(diào)控蛋白所調(diào)控的區(qū)域進(jìn)行點突變:設(shè)計含有不同的突變點的引物, 通過overlap-extension PCR 得到含有突變的調(diào)控蛋白編碼基因, 以及含有突變的啟動子區(qū)域; 將突變后的蛋白克隆到表達(dá)載體上, 純化后分別與啟動子作用, 鑒定調(diào)控蛋白以及啟動子的保守區(qū)域. 5)啟動子區(qū)域的克隆以及啟動子活性的分析:PCR擴(kuò)增預(yù)測的啟動子區(qū)域而得到不同區(qū)域的片段; 將其連接到含有報告基因lacZ 的無啟動子載體上, 通過檢測b-半乳糖苷酶活性來檢測啟動子的強(qiáng)弱。 6)確定轉(zhuǎn)錄起始位點: 7)RT-PCR確定調(diào)控蛋白調(diào)控的操縱子轉(zhuǎn)錄是否是一個轉(zhuǎn)錄單位 |
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