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458699070銀蟲 (小有名氣)
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Chemdrow 3D MM2最小化能量模擬出的結(jié)構(gòu)與ROESY不符怎么辦？
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| 一個環(huán)阿爾廷烷型三萜C環(huán)的構(gòu)型從ROESY信號上看是船型 (boat conformaton)，但用Chem3D 模擬出的結(jié)構(gòu)MM2能量最小化后C環(huán)卻是椅型 (chair conformaton)，請問怎么樣可以把這個3D結(jié)構(gòu)中的C環(huán)調(diào)成船型 (用于文章發(fā)表) 的呢？ |
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3樓2012-11-04 20:13:57
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【答案】應(yīng)助回帖
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呵呵，我是藥劑專業(yè)的，對這個了解也不是很深入，因為前一陣子也想用一下，所以詢問了一些同學(xué)。計算模擬空間構(gòu)象要看你的分子是不是很大了，一般的小分子你可以試試MOE或者discovery studio。這兩個軟件在平時自己的電腦上就可以運行，但是如果你的分子特別大，或者涉及計算跟蛋白有關(guān)的擬合比如分子對接之類的，那可能平常的筆記本電腦就不能勝任了，需要大型的工作站才可以。 |
4樓2012-11-05 08:52:26
458699070
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5樓2012-11-05 09:40:57
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