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zhongyunxia新蟲 (小有名氣)
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請教VMD中measure hbonds
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請教大家,初用VMD中measure hbonds計算氫鍵,體系為一個羧酸體系,供體和受體分別為OH和羰基O,在index中的編號分別是第6組和第5組。 在TKconsole中,這樣寫到,大家看是否有錯 首先按照手冊,selection1是供體,selection2是受體 所以 set sel1 [atomselect top "index 6"] atomselect0 set sel2 [atomselect top "index 5"] atomselect 1 measure hbonds 3.5 30 $sel1 $sel2 回車后出現(xiàn)三個圓括號 {} {} {} 請教大家,這是什么意思呢?而且我輸入$sel1 $sel2時字母變紅,是出現(xiàn)語法錯誤了嗎?就是選擇供體和受體的語句對嗎?如下是我的pdb及index文件,希望大家?guī)兔,謝謝大家,新手初到,望不吝賜教,感激不盡! |
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木蟲 (著名寫手)
新蟲 (小有名氣)
木蟲 (著名寫手)
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