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zhongyunxia新蟲 (小有名氣)
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請(qǐng)教VMD中measure hbonds
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請(qǐng)教大家，初用VMD中measure hbonds計(jì)算氫鍵，體系為一個(gè)羧酸體系，供體和受體分別為OH和羰基O，在index中的編號(hào)分別是第6組和第5組。 在TKconsole中，這樣寫到，大家看是否有錯(cuò) 首先按照手冊(cè)，selection1是供體，selection2是受體 所以 set sel1 [atomselect top "index 6"] atomselect0 set sel2 [atomselect top "index 5"] atomselect 1 measure hbonds 3.5 30 $sel1 $sel2 回車后出現(xiàn)三個(gè)圓括號(hào) {} {} {} 請(qǐng)教大家，這是什么意思呢？而且我輸入$sel1 $sel2時(shí)字母變紅，是出現(xiàn)語法錯(cuò)誤了嗎？就是選擇供體和受體的語句對(duì)嗎？如下是我的pdb及index文件，希望大家?guī)兔Γx謝大家，新手初到，望不吝賜教，感激不盡！ |
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4樓2012-11-20 16:14:56
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