小木蟲于

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[求助] 結(jié)構(gòu)優(yōu)化 siesta 和 vasp

用vasp和siesta優(yōu)化一個結(jié)構(gòu)，結(jié)果差了很多。這是怎么回事，有人碰到過么？

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1樓 2012-12-06 21:08:54

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sunyang1988: 金幣+1, 謝謝提示 2012-12-20 10:25:43
小木蟲于: 金幣+2, ★有幫助 2013-01-28 21:01:40
小木蟲于: 金幣+2, ★有幫助 2013-01-28 21:02:30

你確定用的參數(shù)一樣？
另外vasp 確實更精確，畢竟平面波展開更細(xì)膩啊

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2樓2012-12-20 06:51:03

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引用回帖:

2樓: Originally posted by lu_wei07 at 2012-12-20 06:51:03
你確定用的參數(shù)一樣？
另外vasp 確實更精確，畢竟平面波展開更細(xì)膩啊

1、 vasp采用paw贗勢，pbe交換關(guān)聯(lián)。
2、 siesta采用KB形式的norm-conserving贗勢，pbe交換關(guān)聯(lián)。

用以上兩種方式優(yōu)化雙層石墨烯參雜，發(fā)現(xiàn)，siesta給出比較好的層間距（三點幾埃），而vasp給出四點幾埃。

以前文獻(xiàn)指出，石墨層間距用lda能給出較好的描述，但是gga給出的偏大。當(dāng)然最好的結(jié)果是考慮了vdw作用。

這里siesta用pbe和kb型贗勢組合卻給出了較好的描述。

以上是我的結(jié)果。

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3樓2012-12-20 08:42:55

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小木蟲于: 金幣+2, ★有幫助 2013-01-28 21:01:51

引用回帖:

3樓: Originally posted by 小木蟲于 at 2012-12-20 08:42:55
1、 vasp采用paw贗勢，pbe交換關(guān)聯(lián)。
2、 siesta采用KB形式的norm-conserving贗勢，pbe交換關(guān)聯(lián)。

用以上兩種方式優(yōu)化雙層石墨烯參雜，發(fā)現(xiàn)，siesta給出比較好的層間距（三點幾埃），而vasp給出四點幾埃。

...

你確定vasp收斂了嗎。用vasp 之前首先要測試Ecut,另外你siesta的電子溫度取多少，vasp又用的什么類型的展寬即ismear,sigma,關(guān)于siesta你測試過Pao,energyshift 嗎，等都是考慮的因素，從收斂角度上說，vasp收斂的更好，但是局域性上來說siesta更好，畢竟是原子軌道展開，石墨烯層之間的距離用LDA或者GGA 可以嗎？這個我不是很確定，可能要用到范德瓦爾斯吧，如果牽扯到范德瓦爾斯那這兩個軟件都無能為力，雖然他有，但結(jié)果不好

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4樓2012-12-21 18:00:52

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引用回帖:

4樓: Originally posted by lu_wei07 at 2012-12-21 18:00:52
你確定vasp收斂了嗎。用vasp 之前首先要測試Ecut,另外你siesta的電子溫度取多少，vasp又用的什么類型的展寬即ismear,sigma,關(guān)于siesta你測試過Pao,energyshift 嗎，等都是考慮的因素，從收斂角度上說，vasp收斂的更 ...

vasp的平面波截斷沒有問題的，這個是無數(shù)人應(yīng)用的，vasp的電子占據(jù)方法，和費米面附近展寬這個應(yīng)該可以放心，按照我的經(jīng)驗不會有問題。siesta的實空間網(wǎng)格用的和相識體系文獻(xiàn)的也是一樣的，至于軌道大小用的是dzp，局域程度用的默認(rèn)值。石墨層間用vasp，lda能得到較好的結(jié)果這個是文獻(xiàn)已經(jīng)得到的結(jié)果（carbon 44 231）。
再有就是這兩個軟件都可以實現(xiàn)vdw。

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5樓2012-12-22 08:40:49

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引用回帖:

siesta關(guān)于軌道的測試確實沒有做，對這個還不是很理解，也不太懂如何測試，測試標(biāo)準(zhǔn)如何。望賜教。

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6樓2012-12-22 10:23:22

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小木蟲于: 金幣+2, ★有幫助 2013-01-28 21:02:06

曾經(jīng)遇到過，現(xiàn)在說一個可能性：
VASP做結(jié)構(gòu)優(yōu)化，默認(rèn)的情況下是保持結(jié)構(gòu)的對稱性不變的，SIESTA做結(jié)構(gòu)優(yōu)化，默認(rèn)的情況下是不保持的，也就是說有可能從輸入時的立方結(jié)構(gòu)優(yōu)化成對稱性較低的結(jié)構(gòu)

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7樓2012-12-22 11:17:19

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小木蟲于: 金幣+2, ★有幫助 2013-01-28 21:02:15

引用回帖:

6樓: Originally posted by 小木蟲于 at 2012-12-22 10:23:22
siesta關(guān)于軌道的測試確實沒有做，對這個還不是很理解，也不太懂如何測試，測試標(biāo)準(zhǔn)如何。望賜教。...

所有的測試最終都是看能量是不是最低

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8樓2012-12-22 13:46:22

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