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小木蟲(chóng)于金蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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[求助]
結(jié)構(gòu)優(yōu)化 siesta 和 vasp
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| 用vasp和siesta優(yōu)化一個(gè)結(jié)構(gòu)，結(jié)果差了很多。這是怎么回事，有人碰到過(guò)么？ |
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2樓2012-12-20 06:51:03
小木蟲(chóng)于
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1、 vasp采用paw贗勢(shì)，pbe交換關(guān)聯(lián)。 2、 siesta采用KB形式的norm-conserving贗勢(shì)，pbe交換關(guān)聯(lián)。 用以上兩種方式優(yōu)化雙層石墨烯參雜，發(fā)現(xiàn)，siesta給出比較好的層間距（三點(diǎn)幾埃），而vasp給出四點(diǎn)幾埃。 以前文獻(xiàn)指出，石墨層間距用lda能給出較好的描述，但是gga給出的偏大。當(dāng)然最好的結(jié)果是考慮了vdw作用。 這里siesta用pbe和kb型贗勢(shì)組合卻給出了較好的描述。 以上是我的結(jié)果。 |
3樓2012-12-20 08:42:55
【答案】應(yīng)助回帖
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小木蟲(chóng)于: 金幣+2, ★有幫助 2013-01-28 21:01:51
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你確定vasp收斂了嗎。用vasp 之前首先要測(cè)試Ecut,另外你siesta的電子溫度取多少，vasp又用的什么類(lèi)型的展寬即ismear,sigma,關(guān)于siesta你測(cè)試過(guò)Pao,energyshift 嗎，等都是考慮的因素，從收斂角度上說(shuō)，vasp收斂的更好，但是局域性上來(lái)說(shuō)siesta更好，畢竟是原子軌道展開(kāi)，石墨烯層之間的距離用LDA或者GGA 可以嗎？這個(gè)我不是很確定，可能要用到范德瓦爾斯吧，如果牽扯到范德瓦爾斯那這兩個(gè)軟件都無(wú)能為力，雖然他有，但結(jié)果不好 |
4樓2012-12-21 18:00:52
小木蟲(chóng)于
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vasp的平面波截?cái)鄾](méi)有問(wèn)題的，這個(gè)是無(wú)數(shù)人應(yīng)用的，vasp的電子占據(jù)方法，和費(fèi)米面附近展寬這個(gè)應(yīng)該可以放心，按照我的經(jīng)驗(yàn)不會(huì)有問(wèn)題。siesta的實(shí)空間網(wǎng)格用的和相識(shí)體系文獻(xiàn)的也是一樣的，至于軌道大小用的是dzp，局域程度用的默認(rèn)值。石墨層間用vasp，lda能得到較好的結(jié)果這個(gè)是文獻(xiàn)已經(jīng)得到的結(jié)果（carbon 44 231）。 再有就是這兩個(gè)軟件都可以實(shí)現(xiàn)vdw。 |
5樓2012-12-22 08:40:49
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6樓2012-12-22 10:23:22
【答案】應(yīng)助回帖
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小木蟲(chóng)于: 金幣+2, ★有幫助 2013-01-28 21:02:06
小木蟲(chóng)于: 金幣+2, ★有幫助 2013-01-28 21:02:06
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曾經(jīng)遇到過(guò)，現(xiàn)在說(shuō)一個(gè)可能性： VASP做結(jié)構(gòu)優(yōu)化，默認(rèn)的情況下是保持結(jié)構(gòu)的對(duì)稱(chēng)性不變的，SIESTA做結(jié)構(gòu)優(yōu)化，默認(rèn)的情況下是不保持的，也就是說(shuō)有可能從輸入時(shí)的立方結(jié)構(gòu)優(yōu)化成對(duì)稱(chēng)性較低的結(jié)構(gòu) |
7樓2012-12-22 11:17:19
8樓2012-12-22 13:46:22
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