 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 3621 | 回復(fù): 9 | |||
| 當(dāng)前只顯示滿足指定條件的回帖，點(diǎn)擊這里查看本話題的所有回帖 | |||
[求助]
分子對(duì)接前，含有配體的復(fù)合蛋白怎么處理？HETATM開頭的元素要?jiǎng)h除嗎
|
|||
| 在對(duì)接時(shí)，HETATM開頭的分子是不是一定就是配體，需要?jiǎng)h掉嗎；我現(xiàn)在的PDB文件里面有個(gè)MODRES (對(duì)標(biāo)準(zhǔn)殘基的修飾)的分子，坐標(biāo)前是HETATM開頭，這個(gè)是當(dāng)配體刪掉，還是對(duì)接蛋白的一部分？ |
回復(fù)此樓» 收錄本帖的淘帖專輯推薦
 酶的資料 |
» 猜你喜歡
315求調(diào)劑
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
312求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
一志愿鄭州大學(xué)材料與化工085600，求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
315分 085602 求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
298分 070300求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
349求調(diào)劑
已經(jīng)有9人回復(fù)
-
302求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
化工調(diào)劑303分，過四級(jí)
已經(jīng)有10人回復(fù)
-
321求調(diào)劑
已經(jīng)有14人回復(fù)
-
296材料專碩求調(diào)劑
已經(jīng)有14人回復(fù)
» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- sybyl完成分子對(duì)接后，如何將配體和蛋白一起導(dǎo)出為pdb文件？
已經(jīng)有12人回復(fù)
caohao1988
新蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 1 (幼兒園)
- 金幣: 430.4
- 帖子: 49
- 在線: 14.6小時(shí)
- 蟲號(hào): 1926701
- 注冊(cè): 2012-08-06
- 專業(yè): 生物化學(xué)
7樓2012-12-11 15:52:03
lrf1980
新蟲 (小有名氣)
- 模擬EPI: 1
- 應(yīng)助: 41 (小學(xué)生)
- 金幣: 1254.2
- 紅花: 3
- 帖子: 136
- 在線: 52.5小時(shí)
- 蟲號(hào): 2060967
- 注冊(cè): 2012-10-14
- 專業(yè): 藥物化學(xué)
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
gouyi: 金幣+4, ★★★很有幫助, 我主要是想問一下，其中有一個(gè)修飾的殘基HETATM開頭，要不要?jiǎng)h掉，因?yàn)槲也恢浪降资桥潴w，還是什么 2012-12-10 21:09:45
zh1987hs: 金幣+3, 謝謝 2012-12-11 08:32:03
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
gouyi: 金幣+4, ★★★很有幫助, 我主要是想問一下，其中有一個(gè)修飾的殘基HETATM開頭，要不要?jiǎng)h掉，因?yàn)槲也恢浪降资桥潴w，還是什么 2012-12-10 21:09:45
zh1987hs: 金幣+3, 謝謝 2012-12-11 08:32:03
|
用pymol打開文件，輸入下列命令，基本就能夠得到一個(gè)干凈的分子 remove solvent （去除水分子) remove organic （去除配體化合物） |
2樓2012-12-10 19:25:54
lrf1980
新蟲 (小有名氣)
- 模擬EPI: 1
- 應(yīng)助: 41 (小學(xué)生)
- 金幣: 1254.2
- 紅花: 3
- 帖子: 136
- 在線: 52.5小時(shí)
- 蟲號(hào): 2060967
- 注冊(cè): 2012-10-14
- 專業(yè): 藥物化學(xué)
3樓2012-12-10 22:41:15
yaozhq
金蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 126 (高中生)
- 金幣: 1137.8
- 紅花: 7
- 帖子: 260
- 在線: 37.6小時(shí)
- 蟲號(hào): 1475454
- 注冊(cè): 2011-11-04
- 性別: GG
- 專業(yè): 生物大分子結(jié)構(gòu)與功能
4樓2012-12-11 13:36:55
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 266分，一志愿電氣工程，本科材料，求材料專業(yè)調(diào)劑 +4 | 哇呼哼呼哼 2026-04-02 | 4/200 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 348求調(diào)劑 +6 | 吳彥祖24k 2026-04-02 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 生醫(yī)工0831調(diào)劑求推薦 +5 | 小熊睿睿_s 2026-03-27 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 材料專碩322分 +11 | 哈哈哈吼吼吼哈 2026-04-01 | 11/550 |
|
|
|
[基金申請(qǐng)] esi高被引論文是不是能對(duì)中標(biāo)有所加分和幫助呢 +4 | redcom 2026-04-01 | 4/200 |
|
|
[考研] 266求調(diào)劑 +10 | 陽(yáng)陽(yáng)哇塞 2026-04-01 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 一志愿北京科技，085601總分305求調(diào)劑 +9 | 半生瓜！ 2026-04-01 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 英一數(shù)一408，總分284，二戰(zhàn)真誠(chéng)求調(diào)劑 +12 | 12.27 2026-03-30 | 14/700 |
|
|
|
[考研] 一志愿南昌大學(xué)324求調(diào)劑 +12 | hanamiko 2026-03-27 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 296求調(diào)劑 +4 | 汪��？！ 2026-03-31 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 332求調(diào)劑 +8 | Lyy930824@ 2026-03-29 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 353求調(diào)劑 +4 | 拉鉤不許變 2026-04-01 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 一志愿北交材料工程總分358 +5 | cs0106 2026-04-01 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 070300求調(diào)劑306分 +5 | 26要上岸 2026-03-27 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 土木304求調(diào)劑 +3 | 兔突突突， 2026-03-31 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 286求調(diào)劑 +6 | Faune 2026-03-30 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 266求調(diào)劑 +3 | 哇呼哼呼哼 2026-03-29 | 3/150 |
|
|
|
[有機(jī)交流] 考研調(diào)劑 +8 | watb 2026-03-26 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 316求調(diào)劑 +7 | 江辭666 2026-03-26 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 本科新能源科學(xué)與工程，一志愿華理能動(dòng)285求調(diào)劑 +3 | AZMK 2026-03-27 | 5/250 |
|