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鄧芳木蟲 (小有名氣)
木蟲
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[求助]
autodock什么時(shí)候存在pi-pi interations？
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請(qǐng)問高手：autodock什么時(shí)候存在pi-pi interations？做了很多組對(duì)接沒發(fā)現(xiàn)有這種相互作用的，這種相互作用有什么作用？能說明哪些問題？謝謝 |
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 Autodock |
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| 首先看看你的口袋周圍是否有苯環(huán)殘基，如果沒有，是不可能出現(xiàn)pi-pi的。另外就是你的配體是不是有苯環(huán)或者更大的共軛體系。當(dāng)兩者都有的情況下，空間構(gòu)象匹配就會(huì)出現(xiàn)pi-pi相互作用。pi-pi相互作用的能量還是蠻大的。所以如果體系有pi-pi相互作用，應(yīng)該你的affinity energy相對(duì)會(huì)比較低。至于這種相互作用到底能說明什么問題，這個(gè)就仁者見仁，智者見智了。 |
2樓2013-01-08 15:58:10
鄧芳
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