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yida木蟲 (小有名氣)
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[求助]
Amorphous cell 中的密度問題
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Amorphous cell 中對(duì)密度的定義為: Density: The density in g/cc of the output structure. In the packing task, if the packing region is constrained by an isosurface, this is the density of the isosurface enclosed volume. 但是不是很理解,是溶劑的密度還是其他?這個(gè)密度值如何確定? |
模擬知識(shí)匯總 | Amorphous cell |
鐵桿木蟲 (著名寫手)
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物質(zhì)的密度是T P N 的函數(shù),通常所說的密度都是在常溫常壓下測定的,由于液體可壓縮性較差,P的影響較小,溫度往往起著主要作用。 宏觀上講,一定N,T下,物質(zhì)的密度是一定的,但是具體到模擬,顯然V不能無限大,不然就是呈現(xiàn)氣體狀態(tài)了,所以V應(yīng)該是在一定溶劑相互作用范圍內(nèi)。 加多加少溶劑數(shù)目,這無所謂,只要這個(gè)盒子里溶劑分子分布一致,跟宏觀溶劑狀態(tài)近似就好。 |
鐵桿木蟲 (著名寫手)
木蟲 (小有名氣)
木蟲 (小有名氣)
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